More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0470 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  100 
 
 
658 aa  1344    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
607 aa  595  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  47.63 
 
 
646 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
717 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 
713 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.02 
 
 
646 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.02 
 
 
646 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
696 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
714 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  48.63 
 
 
620 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  48.19 
 
 
663 aa  559  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.9 
 
 
663 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.9 
 
 
663 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.58 
 
 
647 aa  558  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  49.41 
 
 
624 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.22 
 
 
645 aa  552  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.7 
 
 
602 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  48.99 
 
 
625 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  48.91 
 
 
619 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.38 
 
 
614 aa  547  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  47.55 
 
 
645 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0605  cell division protein FtsH  49.83 
 
 
645 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1259  cell division protein FtsH  47.59 
 
 
645 aa  544  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1134  cell division protein FtsH  47.59 
 
 
645 aa  545  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  48.24 
 
 
629 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.03 
 
 
625 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
612 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1761  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.49 
 
 
643 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.17 
 
 
652 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.8 
 
 
621 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  48.15 
 
 
620 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  47.95 
 
 
648 aa  538  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.51 
 
 
612 aa  537  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.05 
 
 
687 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  48.55 
 
 
620 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  49.33 
 
 
635 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  47.63 
 
 
706 aa  534  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.97 
 
 
608 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  45.28 
 
 
623 aa  535  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  47.01 
 
 
615 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.66 
 
 
662 aa  530  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  47.27 
 
 
627 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  46.44 
 
 
616 aa  532  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  46.23 
 
 
641 aa  529  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.63 
 
 
610 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.83 
 
 
623 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.33 
 
 
697 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.89 
 
 
607 aa  530  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1261  cell division protein FtsH  49.42 
 
 
640 aa  531  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.112484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  45.1 
 
 
630 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.45 
 
 
635 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 
610 aa  529  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.89 
 
 
639 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.1 
 
 
652 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 
681 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  47.37 
 
 
616 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  47.48 
 
 
699 aa  526  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.21 
 
 
635 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.46 
 
 
631 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.81 
 
 
615 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.92 
 
 
645 aa  528  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  50.92 
 
 
621 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  46.32 
 
 
628 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.52 
 
 
614 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.93 
 
 
617 aa  522  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.81 
 
 
617 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  44.93 
 
 
691 aa  525  1e-147  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.03 
 
 
706 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
630 aa  524  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.7 
 
 
699 aa  525  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.47 
 
 
607 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.16 
 
 
673 aa  524  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1347  putative cell division protein FtsH-like protein  46.85 
 
 
643 aa  525  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.71 
 
 
605 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  45.9 
 
 
700 aa  521  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.19 
 
 
628 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.94 
 
 
705 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  46.6 
 
 
627 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.91 
 
 
673 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.7 
 
 
618 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  48.15 
 
 
624 aa  521  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  48.31 
 
 
620 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.19 
 
 
628 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.56 
 
 
635 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  45.53 
 
 
702 aa  522  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.9 
 
 
644 aa  522  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  46.12 
 
 
635 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.75 
 
 
640 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.23 
 
 
634 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  46.02 
 
 
641 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.76 
 
 
649 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.91 
 
 
673 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.5 
 
 
640 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  45.8 
 
 
694 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 
697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.72 
 
 
652 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  46.53 
 
 
621 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  46.55 
 
 
605 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.16 
 
 
638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  50.09 
 
 
652 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>