More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0579 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.63 
 
 		 681 aa  707    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.69 
 
 		 608 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.63 
 
 		 662 aa  657    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 717 aa  1452    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  98.61 
 
 		 713 aa  1402    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.1 
 
 		 644 aa  612  9.999999999999999e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 		 625 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.5 
 
 		 646 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  51.47 
 
 		 624 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.77 
 
 		 623 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.5 
 
 		 646 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  50.81 
 
 		 623 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  51.65 
 
 		 645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  51.49 
 
 		 619 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  51.62 
 
 		 621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  51 
 
 		 658 aa  575  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  51.33 
 
 		 620 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  51.32 
 
 		 625 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.85 
 
 		 645 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  54.67 
 
 		 646 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  51.47 
 
 		 635 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 647 aa  569  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.76 
 
 		 611 aa  568  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  50.66 
 
 		 629 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 618 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.25 
 
 		 630 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 618 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  48.95 
 
 		 621 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 623 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 607 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.98 
 
 		 614 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 		 663 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.18 
 
 		 615 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 605 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.35 
 
 		 714 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  51.33 
 
 		 620 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 		 663 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.35 
 
 		 696 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 		 624 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.17 
 
 		 676 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.08 
 
 		 697 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.02 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  52.05 
 
 		 620 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 		 621 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  49.75 
 
 		 605 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.37 
 
 		 602 aa  554  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.18 
 
 		 610 aa  554  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  50.83 
 
 		 620 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.7 
 
 		 607 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.78 
 
 		 699 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.91 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  47.7 
 
 		 638 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.41 
 
 		 676 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  50.33 
 
 		 624 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  49.33 
 
 		 627 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.26 
 
 		 607 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 		 612 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  47.16 
 
 		 627 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  47.75 
 
 		 630 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.44 
 
 		 608 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.57 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.33 
 
 		 610 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.6 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.96 
 
 		 612 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.38 
 
 		 673 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  57.77 
 
 		 682 aa  545  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.75 
 
 		 653 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.81 
 
 		 610 aa  545  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.43 
 
 		 697 aa  543  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 		 667 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.09 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.85 
 
 		 645 aa  545  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 		 615 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47 
 
 		 658 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.05 
 
 		 639 aa  541  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  51.82 
 
 		 635 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 		 671 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  50.65 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  47.03 
 
 		 681 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.54 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.47 
 
 		 647 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.89 
 
 		 630 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  46.9 
 
 		 627 aa  540  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  48.27 
 
 		 616 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.74 
 
 		 655 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  49.19 
 
 		 656 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.6 
 
 		 634 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  50.29 
 
 		 917 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  46.99 
 
 		 616 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.33 
 
 		 614 aa  537  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.42 
 
 		 655 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.71 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.61 
 
 		 633 aa  538  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.89 
 
 		 637 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.41 
 
 		 617 aa  537  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.29 
 
 		 852 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.29 
 
 		 666 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.29 
 
 		 666 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>