More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0078 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.65 
 
 
686 aa  1051    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.88 
 
 
697 aa  1075    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.95 
 
 
685 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.26 
 
 
699 aa  1040    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.86 
 
 
696 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  100 
 
 
706 aa  1447    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  74.2 
 
 
699 aa  993    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.86 
 
 
714 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.4 
 
 
676 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.32 
 
 
694 aa  1073    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.46 
 
 
697 aa  717    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  77.57 
 
 
694 aa  1074    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  61.91 
 
 
691 aa  632  1e-180  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.39 
 
 
696 aa  632  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  49.85 
 
 
646 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  52.31 
 
 
692 aa  629  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
706 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.79 
 
 
607 aa  621  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.48 
 
 
663 aa  618  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.48 
 
 
663 aa  618  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
705 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.85 
 
 
673 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  51.7 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.4 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
635 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  50 
 
 
702 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.56 
 
 
687 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.67 
 
 
639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.75 
 
 
646 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.07 
 
 
635 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  50.89 
 
 
692 aa  602  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.75 
 
 
646 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  50.56 
 
 
616 aa  601  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 
658 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.72 
 
 
602 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.13 
 
 
623 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.73 
 
 
635 aa  594  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
676 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  49.2 
 
 
627 aa  588  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.68 
 
 
653 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.6 
 
 
623 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
618 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  50.16 
 
 
621 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
618 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 
658 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 
658 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.46 
 
 
615 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  49.84 
 
 
615 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.55 
 
 
662 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  48.53 
 
 
605 aa  582  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 
605 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
655 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  48.38 
 
 
630 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
655 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.15 
 
 
667 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  48.37 
 
 
627 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.29 
 
 
624 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
610 aa  577  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.42 
 
 
630 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 
645 aa  569  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
666 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
666 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
666 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  47.59 
 
 
917 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  46.66 
 
 
691 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
666 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.59 
 
 
852 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
666 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  48.79 
 
 
623 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.95 
 
 
610 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  47.95 
 
 
659 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 
615 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.56 
 
 
625 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  48.5 
 
 
673 aa  563  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  50.17 
 
 
645 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  48.04 
 
 
620 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.36 
 
 
601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
601 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  47.63 
 
 
658 aa  559  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  49.03 
 
 
624 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  47.78 
 
 
619 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  48.33 
 
 
625 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.65 
 
 
610 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.08 
 
 
610 aa  552  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  48.89 
 
 
638 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.42 
 
 
673 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  47.78 
 
 
629 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.58 
 
 
616 aa  554  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.56 
 
 
608 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.12 
 
 
645 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.53 
 
 
645 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.27 
 
 
647 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  47.27 
 
 
639 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.22 
 
 
607 aa  552  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.42 
 
 
673 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 
607 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
639 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  48.17 
 
 
629 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.49 
 
 
616 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>