More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1261 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1134  cell division protein FtsH  88.28 
 
 
645 aa  1083    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1259  cell division protein FtsH  88.02 
 
 
645 aa  1085    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  68.19 
 
 
663 aa  861    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1261  cell division protein FtsH  100 
 
 
640 aa  1295    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.112484  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  76.96 
 
 
648 aa  940    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  77.18 
 
 
641 aa  932    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0605  cell division protein FtsH  87.86 
 
 
645 aa  1052    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1347  putative cell division protein FtsH-like protein  80.3 
 
 
643 aa  971    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1761  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.35 
 
 
643 aa  943    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  78.45 
 
 
643 aa  910    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  48.8 
 
 
623 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  49.37 
 
 
620 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.94 
 
 
646 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.94 
 
 
646 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.96 
 
 
607 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.52 
 
 
625 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  50.74 
 
 
624 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  48.72 
 
 
629 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.81 
 
 
623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  49.76 
 
 
625 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  49.52 
 
 
619 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  46.5 
 
 
658 aa  554  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.7 
 
 
635 aa  555  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  49.29 
 
 
620 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.91 
 
 
696 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  47.71 
 
 
630 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  50.99 
 
 
635 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 
686 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.41 
 
 
610 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  47.23 
 
 
635 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
624 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  49.45 
 
 
620 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.91 
 
 
714 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 
605 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.66 
 
 
623 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 
673 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  49.32 
 
 
646 aa  545  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.68 
 
 
697 aa  544  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  49.06 
 
 
627 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 
673 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  50 
 
 
605 aa  545  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.43 
 
 
699 aa  544  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.04 
 
 
645 aa  538  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  48.27 
 
 
627 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  50.51 
 
 
645 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  48.24 
 
 
624 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.93 
 
 
663 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  50.66 
 
 
620 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.93 
 
 
663 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  50.17 
 
 
621 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.89 
 
 
681 aa  538  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.31 
 
 
610 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.77 
 
 
618 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.01 
 
 
607 aa  535  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.59 
 
 
618 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  48.59 
 
 
621 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.13 
 
 
647 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.02 
 
 
630 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.89 
 
 
687 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.78 
 
 
615 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.67 
 
 
607 aa  530  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.15 
 
 
615 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.2 
 
 
633 aa  531  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.51 
 
 
618 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  48.7 
 
 
616 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  45.57 
 
 
706 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.34 
 
 
694 aa  524  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 
717 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.02 
 
 
713 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.64 
 
 
635 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.22 
 
 
635 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.23 
 
 
616 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.88 
 
 
706 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.79 
 
 
705 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.27 
 
 
852 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  46.27 
 
 
917 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.43 
 
 
667 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  45.11 
 
 
702 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.99 
 
 
631 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.16 
 
 
602 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.38 
 
 
653 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.34 
 
 
638 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.99 
 
 
641 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.7 
 
 
640 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  45.54 
 
 
626 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  46.56 
 
 
627 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.53 
 
 
630 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.75 
 
 
639 aa  512  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.53 
 
 
649 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.57 
 
 
630 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.54 
 
 
645 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  49.02 
 
 
618 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  43.99 
 
 
641 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  45.73 
 
 
694 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.58 
 
 
662 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>