More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3415 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.21 
 
 
618 aa  734    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  65.73 
 
 
630 aa  809    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.14 
 
 
623 aa  737    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.04 
 
 
618 aa  897    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.83 
 
 
610 aa  784    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.37 
 
 
645 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  100 
 
 
627 aa  1263    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.99 
 
 
617 aa  692    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.05 
 
 
618 aa  732    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.83 
 
 
635 aa  754    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.17 
 
 
633 aa  700    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  64.38 
 
 
621 aa  734    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  61.08 
 
 
618 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.89 
 
 
616 aa  896    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  96.51 
 
 
605 aa  1174    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  73.18 
 
 
609 aa  877    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  64.13 
 
 
615 aa  744    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  64.7 
 
 
617 aa  719    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  64.44 
 
 
616 aa  767    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.61 
 
 
610 aa  803    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  96.01 
 
 
624 aa  1211    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.46 
 
 
607 aa  703    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  95.85 
 
 
605 aa  1166    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  95.08 
 
 
615 aa  1145    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.71 
 
 
607 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.01 
 
 
615 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  53.55 
 
 
635 aa  620  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.21 
 
 
696 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.21 
 
 
714 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.57 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 
646 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 
646 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  52.39 
 
 
646 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 
663 aa  598  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 
663 aa  598  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.59 
 
 
645 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  55.4 
 
 
645 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.13 
 
 
623 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 
697 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  48.47 
 
 
694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.44 
 
 
694 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.75 
 
 
625 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  50.64 
 
 
627 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  53.58 
 
 
625 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  50.08 
 
 
659 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 
655 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 
655 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  52.44 
 
 
619 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
676 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  51.26 
 
 
620 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.58 
 
 
658 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  48.25 
 
 
692 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.24 
 
 
630 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  50.49 
 
 
624 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  48.37 
 
 
706 aa  557  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  52.23 
 
 
629 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
667 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 
687 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  52.94 
 
 
623 aa  555  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.55 
 
 
699 aa  553  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.47 
 
 
686 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 
717 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.5 
 
 
713 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  51.03 
 
 
621 aa  553  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 
673 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 
673 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.33 
 
 
616 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  48.94 
 
 
699 aa  550  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  49.48 
 
 
648 aa  550  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  51.42 
 
 
620 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.58 
 
 
658 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.35 
 
 
635 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.58 
 
 
658 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1347  putative cell division protein FtsH-like protein  49.15 
 
 
643 aa  551  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.19 
 
 
681 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  49.32 
 
 
643 aa  548  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  50.33 
 
 
635 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.41 
 
 
635 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  51.09 
 
 
620 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 
653 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.75 
 
 
673 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  50.34 
 
 
614 aa  545  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1259  cell division protein FtsH  50.17 
 
 
645 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.41 
 
 
714 aa  544  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0605  cell division protein FtsH  49.83 
 
 
645 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  49.92 
 
 
624 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.34 
 
 
608 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.02 
 
 
705 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  52.06 
 
 
620 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
662 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  50.73 
 
 
702 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.2 
 
 
706 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.2 
 
 
634 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1134  cell division protein FtsH  50.17 
 
 
645 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 
666 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 
666 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  49.17 
 
 
917 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 
852 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.34 
 
 
607 aa  538  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.3 
 
 
641 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>