More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1112 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.22 
 
 
658 aa  880    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.03 
 
 
666 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.86 
 
 
666 aa  830    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.86 
 
 
852 aa  828    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.86 
 
 
666 aa  830    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.89 
 
 
655 aa  860    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.17 
 
 
635 aa  852    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  59.1 
 
 
646 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  57.03 
 
 
627 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  58.93 
 
 
635 aa  699    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  72.03 
 
 
917 aa  829    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.46 
 
 
635 aa  850    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  69.78 
 
 
692 aa  878    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.93 
 
 
714 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.86 
 
 
666 aa  830    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.55 
 
 
662 aa  828    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.13 
 
 
666 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
653 aa  1325    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.93 
 
 
696 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.65 
 
 
663 aa  713    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.65 
 
 
663 aa  713    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  70.2 
 
 
659 aa  828    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.74 
 
 
676 aa  869    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.58 
 
 
658 aa  859    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.4 
 
 
655 aa  854    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.58 
 
 
658 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.24 
 
 
647 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.95 
 
 
607 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.19 
 
 
697 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.19 
 
 
630 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  47.68 
 
 
706 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
697 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.86 
 
 
694 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  49.83 
 
 
694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.26 
 
 
646 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.44 
 
 
645 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.26 
 
 
646 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.78 
 
 
614 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  49.59 
 
 
615 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.11 
 
 
699 aa  555  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.53 
 
 
686 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.49 
 
 
714 aa  558  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  48.32 
 
 
699 aa  554  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.03 
 
 
645 aa  554  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  49.59 
 
 
702 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 
705 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
706 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  51.38 
 
 
645 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
605 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 
623 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.76 
 
 
612 aa  551  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  49.84 
 
 
605 aa  549  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
624 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.09 
 
 
687 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.48 
 
 
602 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  49.16 
 
 
630 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 
618 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  49.43 
 
 
627 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.63 
 
 
635 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 
612 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.36 
 
 
639 aa  548  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48 
 
 
610 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  49.83 
 
 
616 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.79 
 
 
618 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 
637 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.63 
 
 
608 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.71 
 
 
617 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  48.79 
 
 
621 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.75 
 
 
717 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.29 
 
 
713 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.91 
 
 
625 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.79 
 
 
618 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.98 
 
 
610 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 
615 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.01 
 
 
645 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.71 
 
 
610 aa  537  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.22 
 
 
610 aa  533  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 
615 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 
676 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.06 
 
 
607 aa  534  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  48.02 
 
 
618 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  50.34 
 
 
637 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  46.04 
 
 
629 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 
623 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.45 
 
 
647 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.53 
 
 
652 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.02 
 
 
611 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  51.9 
 
 
691 aa  526  1e-148  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  48.34 
 
 
665 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.53 
 
 
652 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.38 
 
 
667 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.06 
 
 
673 aa  527  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.67 
 
 
621 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  44.32 
 
 
633 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  44.32 
 
 
633 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  44.32 
 
 
633 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.41 
 
 
645 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.02 
 
 
640 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  47.15 
 
 
613 aa  522  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.79 
 
 
633 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>