More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4334 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.95 
 
 
663 aa  705    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.5 
 
 
714 aa  715    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.11 
 
 
666 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.11 
 
 
852 aa  862    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.11 
 
 
666 aa  865    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  84.95 
 
 
676 aa  1119    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  56.9 
 
 
646 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  59.31 
 
 
627 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.89 
 
 
653 aa  860    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
655 aa  1321    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  69.27 
 
 
917 aa  864    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  58.05 
 
 
635 aa  687    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  88.15 
 
 
692 aa  1163    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.61 
 
 
662 aa  864    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.5 
 
 
696 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  78.08 
 
 
635 aa  987    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  69.47 
 
 
659 aa  850    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  76.92 
 
 
635 aa  988    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  87.06 
 
 
658 aa  1127    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.11 
 
 
666 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.27 
 
 
666 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.27 
 
 
666 aa  867    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  98.78 
 
 
655 aa  1311    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  87.06 
 
 
658 aa  1127    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.95 
 
 
663 aa  705    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 
647 aa  658    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  87.06 
 
 
658 aa  1145    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  51.24 
 
 
630 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
697 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 
607 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.14 
 
 
687 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 
646 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 
646 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  50.4 
 
 
694 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 
624 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  50.83 
 
 
615 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
625 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.83 
 
 
706 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  48.06 
 
 
627 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  50.56 
 
 
623 aa  568  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.12 
 
 
610 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.38 
 
 
623 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.76 
 
 
705 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
610 aa  564  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  52.27 
 
 
702 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.97 
 
 
630 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  50.89 
 
 
616 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  50.24 
 
 
706 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.49 
 
 
686 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.26 
 
 
635 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.35 
 
 
699 aa  561  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  48.95 
 
 
605 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.37 
 
 
618 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.35 
 
 
605 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  49.83 
 
 
699 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.16 
 
 
694 aa  556  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
633 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  51.09 
 
 
645 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 
615 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 
623 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.41 
 
 
639 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.38 
 
 
645 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.4 
 
 
616 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 
645 aa  548  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 
617 aa  545  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.1 
 
 
714 aa  545  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.36 
 
 
618 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.85 
 
 
673 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.85 
 
 
673 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.31 
 
 
667 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.36 
 
 
618 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  49.2 
 
 
621 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  49.91 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.83 
 
 
612 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  50.34 
 
 
618 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.42 
 
 
717 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.54 
 
 
612 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  49.91 
 
 
617 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.42 
 
 
713 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.47 
 
 
607 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.27 
 
 
614 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.82 
 
 
631 aa  533  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.131641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.9 
 
 
608 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.25 
 
 
652 aa  532  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.59 
 
 
652 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.67 
 
 
610 aa  532  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.86 
 
 
610 aa  533  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.02 
 
 
615 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 
641 aa  532  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  49.57 
 
 
629 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  53.14 
 
 
691 aa  530  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.3 
 
 
640 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  47.6 
 
 
625 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.26 
 
 
647 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  47.5 
 
 
621 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  50.91 
 
 
620 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  46.56 
 
 
624 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.81 
 
 
637 aa  528  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.97 
 
 
602 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>