More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_13071 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.84 
 
 
623 aa  811    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  91.28 
 
 
635 aa  1133    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.59 
 
 
667 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  91.6 
 
 
624 aa  1157    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.92 
 
 
673 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  61.47 
 
 
645 aa  685    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.45 
 
 
625 aa  836    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  90 
 
 
629 aa  1121    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  89.68 
 
 
624 aa  1082    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  91.76 
 
 
620 aa  1116    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  73.27 
 
 
623 aa  884    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  91.92 
 
 
620 aa  1159    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  89.66 
 
 
625 aa  1127    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  91.28 
 
 
620 aa  1134    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.92 
 
 
673 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  64.57 
 
 
621 aa  773    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  100 
 
 
619 aa  1246    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  91.92 
 
 
620 aa  1140    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.62 
 
 
646 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.54 
 
 
645 aa  681    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.62 
 
 
646 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.54 
 
 
623 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 
663 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 
663 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
610 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  51.04 
 
 
646 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
610 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 
607 aa  585  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.77 
 
 
639 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  51.53 
 
 
702 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.07 
 
 
633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.79 
 
 
605 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.42 
 
 
630 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.76 
 
 
696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  51.48 
 
 
621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 
717 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 
713 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
714 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  51.55 
 
 
617 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 
705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 
706 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 
618 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  51.23 
 
 
630 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  53.46 
 
 
605 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.54 
 
 
687 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  51.54 
 
 
617 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  51.39 
 
 
617 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 
618 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 
610 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.81 
 
 
647 aa  570  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.7 
 
 
602 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  49.66 
 
 
608 aa  568  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 
624 aa  565  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.25 
 
 
638 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.99 
 
 
613 aa  564  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.42 
 
 
616 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  48.67 
 
 
641 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  52.44 
 
 
627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 
676 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.93 
 
 
614 aa  563  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  49.5 
 
 
614 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  51.81 
 
 
637 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.47 
 
 
697 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
645 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
617 aa  559  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.19 
 
 
616 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.37 
 
 
615 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 
637 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.19 
 
 
616 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.1 
 
 
621 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 
615 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 
660 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1259  cell division protein FtsH  49.84 
 
 
645 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  50.33 
 
 
613 aa  555  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 
635 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  49.84 
 
 
616 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  48.94 
 
 
639 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1134  cell division protein FtsH  49.84 
 
 
645 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
610 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  52.3 
 
 
643 aa  553  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  49.83 
 
 
616 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.75 
 
 
665 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  50.89 
 
 
619 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  50.58 
 
 
613 aa  554  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  49.59 
 
 
602 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.05 
 
 
607 aa  555  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0605  cell division protein FtsH  51.29 
 
 
645 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  51.05 
 
 
693 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  48.91 
 
 
658 aa  550  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  49.26 
 
 
618 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  48.09 
 
 
647 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  47.76 
 
 
647 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.67 
 
 
612 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.51 
 
 
660 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  47.93 
 
 
647 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 
620 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 
650 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.43 
 
 
656 aa  548  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  48.09 
 
 
647 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  47.93 
 
 
647 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>