More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1293 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.98 
 
 
662 aa  718    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.16 
 
 
681 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.28 
 
 
717 aa  688    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.28 
 
 
713 aa  687    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.7 
 
 
644 aa  670    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
608 aa  1244    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
625 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  48.87 
 
 
623 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 
623 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  49.19 
 
 
624 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  50 
 
 
621 aa  544  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  47.23 
 
 
629 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 
646 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 
646 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  47.39 
 
 
619 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  48.86 
 
 
635 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.47 
 
 
630 aa  532  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 
607 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  46.83 
 
 
625 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.49 
 
 
637 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.32 
 
 
614 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.75 
 
 
617 aa  528  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.07 
 
 
676 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  48.82 
 
 
605 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  46.92 
 
 
620 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.04 
 
 
647 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 
605 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.02 
 
 
610 aa  522  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.78 
 
 
660 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
618 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.31 
 
 
696 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  46.94 
 
 
624 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.32 
 
 
608 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  47.8 
 
 
627 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  47.19 
 
 
616 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  46.98 
 
 
621 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
618 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.8 
 
 
624 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.25 
 
 
621 aa  525  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.68 
 
 
610 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.31 
 
 
714 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.43 
 
 
637 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.39 
 
 
607 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.27 
 
 
618 aa  519  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  47.32 
 
 
665 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.1 
 
 
640 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 
645 aa  519  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.02 
 
 
643 aa  518  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.25 
 
 
645 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.85 
 
 
610 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.01 
 
 
610 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  44.44 
 
 
658 aa  518  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  46.75 
 
 
620 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.65 
 
 
639 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  46.86 
 
 
645 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
671 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.36 
 
 
663 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.32 
 
 
656 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.37 
 
 
627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.36 
 
 
663 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.1 
 
 
636 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.14 
 
 
615 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  47.32 
 
 
682 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  44.59 
 
 
646 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.6 
 
 
614 aa  513  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.59 
 
 
641 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  49.12 
 
 
609 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 
640 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.87 
 
 
607 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  45.79 
 
 
660 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.63 
 
 
638 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  46.43 
 
 
620 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
673 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.96 
 
 
650 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.91 
 
 
640 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  45.12 
 
 
644 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.96 
 
 
654 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.12 
 
 
615 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  45.12 
 
 
647 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.43 
 
 
612 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.27 
 
 
667 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
673 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  46.42 
 
 
639 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.85 
 
 
634 aa  510  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.19 
 
 
611 aa  508  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  44.96 
 
 
647 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  45.12 
 
 
643 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  47.64 
 
 
640 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  45.39 
 
 
641 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.02 
 
 
641 aa  507  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.47 
 
 
635 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.68 
 
 
640 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  46.39 
 
 
659 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.32 
 
 
635 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.3 
 
 
636 aa  508  9.999999999999999e-143  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.43 
 
 
638 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  45.45 
 
 
658 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.77 
 
 
673 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.08 
 
 
640 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.24 
 
 
640 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>