More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2822 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  63.25 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  42.05 
 
 		 326 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  39.5 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 391 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  41.94 
 
 		 389 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  38.5 
 
 		 325 aa  141  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  38.81 
 
 		 390 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  41.46 
 
 		 370 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  41.88 
 
 		 369 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  30.32 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  39.53 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  41.46 
 
 		 363 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  39.08 
 
 		 369 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  41.11 
 
 		 322 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  36.82 
 
 		 388 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  34.47 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  37.5 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  33.95 
 
 		 322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  35.71 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  39.44 
 
 		 335 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  37.28 
 
 		 360 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  36.32 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  32.88 
 
 		 335 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  39.76 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  34.41 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  34.41 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  40.76 
 
 		 388 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  29.17 
 
 		 332 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  29.17 
 
 		 332 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  36.46 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  36.46 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  36.46 
 
 		 352 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  44.1 
 
 		 405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  36.36 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  36.26 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  34.34 
 
 		 336 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  34.52 
 
 		 330 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  32.18 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  35.35 
 
 		 336 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  31.17 
 
 		 322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  34.17 
 
 		 328 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  36.31 
 
 		 367 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  41.08 
 
 		 425 aa  118  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  36.69 
 
 		 348 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  35.56 
 
 		 328 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  34.44 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  34.76 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  30.34 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  35.9 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  36.69 
 
 		 332 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.39 
 
 		 335 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  40.74 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  42.65 
 
 		 355 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  33.5 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  31.47 
 
 		 336 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  31.79 
 
 		 366 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  41.45 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  33.33 
 
 		 336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  38.82 
 
 		 451 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  36.22 
 
 		 419 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  38.37 
 
 		 477 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  37.97 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  37.72 
 
 		 430 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  36.99 
 
 		 468 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  35.68 
 
 		 493 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  34.59 
 
 		 459 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.29 
 
 		 401 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  35.6 
 
 		 419 aa  101  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  42.96 
 
 		 428 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  42.22 
 
 		 424 aa  99  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  35.26 
 
 		 426 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 		 577 aa  92  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  31.22 
 
 		 442 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  28.71 
 
 		 578 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  28.24 
 
 		 570 aa  89.4  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1068  putative cell division protease FtsH-like protein  32.76 
 
 		 556 aa  89.4  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.427704  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  28.24 
 
 		 570 aa  89  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  31.71 
 
 		 617 aa  89  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  27.96 
 
 		 570 aa  88.6  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  34.71 
 
 		 804 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  39.39 
 
 		 351 aa  87.8  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  35.58 
 
 		 414 aa  88.2  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  30.85 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  33.92 
 
 		 450 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  29.65 
 
 		 570 aa  87  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  37.75 
 
 		 688 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.41 
 
 		 651 aa  85.5  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  29.13 
 
 		 369 aa  85.9  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 434 aa  85.5  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  28.88 
 
 		 655 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  32.04 
 
 		 580 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1262  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.610508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  31.94 
 
 		 569 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1351  M41 family peptidase  34.72 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000179169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.99 
 
 		 641 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  31.43 
 
 		 656 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>