More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1073 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 328 aa  667    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  52.78 
 
 		 322 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  54.57 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  54.83 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  53.61 
 
 		 328 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  52.32 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  51.26 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  51.06 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  52.29 
 
 		 329 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  51.99 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  45.9 
 
 		 327 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  50.78 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  50.32 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  47.42 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  48.29 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  46.5 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  47.81 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  47.81 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  47.58 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  46.11 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  47.84 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  45.76 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  45.79 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  46.06 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  33.54 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  33.23 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.47 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.69 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.82 
 
 		 348 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.4 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  36.22 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  31.8 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  39.13 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  34.8 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.82 
 
 		 391 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  35.34 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  32.2 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  37.99 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  38.24 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  38.24 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  36.57 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  39.16 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  39.16 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  37.06 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  29.13 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  28.15 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  35.64 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  35.88 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  32.58 
 
 		 425 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.33 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  30.36 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  33 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.54 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.11 
 
 		 451 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  34.17 
 
 		 239 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 		 468 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  36.69 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  37.27 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  28.4 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  33.19 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.85 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  30.98 
 
 		 426 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  35.71 
 
 		 388 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  30.99 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.12 
 
 		 493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  43.17 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  35.37 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  28.24 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  32.98 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  35.45 
 
 		 692 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.25 
 
 		 685 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  30.67 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  30.16 
 
 		 673 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.97 
 
 		 662 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.93 
 
 		 625 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  31.47 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  27.34 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  33.16 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  33.19 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  34.07 
 
 		 393 aa  105  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.1 
 
 		 659 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.94 
 
 		 641 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.51 
 
 		 676 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  34.33 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  32.29 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.37 
 
 		 640 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.08 
 
 		 640 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.1 
 
 		 643 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  30.4 
 
 		 663 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  33.89 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  31.37 
 
 		 641 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.23 
 
 		 640 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.23 
 
 		 638 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.73 
 
 		 642 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.24 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  30.08 
 
 		 691 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1761  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 643 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  35.84 
 
 		 621 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.1 
 
 		 639 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>