More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3001 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  55.05 
 
 		 673 aa  655    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.42 
 
 		 641 aa  673    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.72 
 
 		 673 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  66.51 
 
 		 691 aa  858    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  54.29 
 
 		 691 aa  689    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.93 
 
 		 652 aa  679    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  68.63 
 
 		 692 aa  920    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 676 aa  1384    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.57 
 
 		 696 aa  811    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.81 
 
 		 685 aa  1044    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.65 
 
 		 697 aa  721    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.2 
 
 		 697 aa  629  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  64.56 
 
 		 699 aa  629  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  52.4 
 
 		 706 aa  618  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  53.6 
 
 		 648 aa  618  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.86 
 
 		 699 aa  609  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.19 
 
 		 694 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  50.81 
 
 		 867 aa  607  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  52.92 
 
 		 694 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  51.92 
 
 		 817 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  47.72 
 
 		 883 aa  600  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.74 
 
 		 686 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  53.91 
 
 		 590 aa  580  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  47.18 
 
 		 787 aa  576  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  61.37 
 
 		 476 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.52 
 
 		 647 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.23 
 
 		 639 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  46.88 
 
 		 646 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.46 
 
 		 714 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.46 
 
 		 696 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.6 
 
 		 615 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.7 
 
 		 639 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.17 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.9 
 
 		 602 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  53.88 
 
 		 614 aa  531  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.31 
 
 		 635 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.84 
 
 		 608 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  47.11 
 
 		 635 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  47.56 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  47.72 
 
 		 633 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  47.56 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  47.56 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  47.56 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  47.56 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.68 
 
 		 676 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.91 
 
 		 658 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  47.56 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.01 
 
 		 635 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  47.8 
 
 		 633 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.36 
 
 		 646 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.36 
 
 		 646 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.6 
 
 		 652 aa  527  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.72 
 
 		 652 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.42 
 
 		 697 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  53.2 
 
 		 700 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.42 
 
 		 697 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  53.68 
 
 		 682 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  53.98 
 
 		 611 aa  524  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.6 
 
 		 632 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  52.58 
 
 		 917 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  45.89 
 
 		 692 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  47.8 
 
 		 633 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  53.11 
 
 		 613 aa  524  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.62 
 
 		 610 aa  523  1e-147  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  54.36 
 
 		 659 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.24 
 
 		 633 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.32 
 
 		 663 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.22 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 666 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  46.21 
 
 		 627 aa  522  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 666 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.58 
 
 		 618 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 666 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  45.21 
 
 		 662 aa  519  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  46.74 
 
 		 621 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.26 
 
 		 640 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 		 630 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.58 
 
 		 852 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.32 
 
 		 663 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 666 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.02 
 
 		 658 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  55.37 
 
 		 627 aa  519  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 666 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.02 
 
 		 658 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.98 
 
 		 673 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.44 
 
 		 621 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  52.8 
 
 		 652 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.76 
 
 		 635 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  52.72 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52 
 
 		 643 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.18 
 
 		 662 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  49.63 
 
 		 651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.89 
 
 		 662 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.99 
 
 		 631 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.42 
 
 		 618 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.62 
 
 		 617 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.69 
 
 		 610 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  45.2 
 
 		 617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 		 655 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  54.1 
 
 		 654 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>