More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2659 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
322 aa  636    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  54.74 
 
 
335 aa  352  5e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  51.23 
 
 
324 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  50.46 
 
 
338 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  52.17 
 
 
332 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  52.17 
 
 
332 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  52.22 
 
 
320 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  52.73 
 
 
323 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  52.73 
 
 
323 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  48.6 
 
 
322 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  50.62 
 
 
352 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  52.65 
 
 
366 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  38.24 
 
 
326 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  36.04 
 
 
328 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  32.48 
 
 
391 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  36.47 
 
 
326 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  36.67 
 
 
328 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  40.21 
 
 
363 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  36.27 
 
 
322 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  36.51 
 
 
328 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.19 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  32.73 
 
 
329 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  37.05 
 
 
328 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  32.73 
 
 
329 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  33.63 
 
 
335 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  37.01 
 
 
327 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  35.8 
 
 
327 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  29.32 
 
 
327 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  35.8 
 
 
327 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  30.18 
 
 
332 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  32.94 
 
 
335 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  36.72 
 
 
328 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  37.11 
 
 
336 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  37.19 
 
 
308 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  36.2 
 
 
336 aa  149  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  33.22 
 
 
388 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  36.4 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  42.92 
 
 
367 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  32.11 
 
 
328 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  36.39 
 
 
330 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  30.65 
 
 
325 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  34.93 
 
 
332 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  40.67 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  35.15 
 
 
336 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  34.65 
 
 
401 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  33.62 
 
 
370 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  35.69 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  34.05 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  34.87 
 
 
468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  31.15 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 
459 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  37.5 
 
 
325 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  37.38 
 
 
405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  34.53 
 
 
389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  37.8 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  38.16 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  35.44 
 
 
477 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  37.32 
 
 
451 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  39.88 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  37.8 
 
 
428 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  41.98 
 
 
369 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  34.19 
 
 
493 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  37.71 
 
 
424 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  33.01 
 
 
360 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  34.58 
 
 
345 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  41.29 
 
 
355 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  41.76 
 
 
425 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  33.47 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  38.86 
 
 
419 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.88 
 
 
759 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  30.19 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  37.72 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  31.17 
 
 
239 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  34.34 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  41.14 
 
 
419 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.5 
 
 
769 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.96 
 
 
768 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  33.18 
 
 
371 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  35.8 
 
 
371 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  40.69 
 
 
688 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  36.53 
 
 
371 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.56 
 
 
760 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.12 
 
 
737 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  35.93 
 
 
371 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  35.2 
 
 
703 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  37.37 
 
 
601 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.85 
 
 
738 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  33.18 
 
 
814 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  33.18 
 
 
632 aa  102  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.83 
 
 
736 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.65 
 
 
718 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.41 
 
 
701 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.71 
 
 
852 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33 
 
 
737 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.25 
 
 
735 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.56 
 
 
659 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  36.67 
 
 
1178 aa  99.8  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.45 
 
 
643 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.88 
 
 
632 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  31.65 
 
 
637 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>