More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2600 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  57.89 
 
 		 673 aa  719    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  55.3 
 
 		 691 aa  681    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.1 
 
 		 696 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.96 
 
 		 673 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.18 
 
 		 652 aa  869    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 641 aa  1300    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  72.46 
 
 		 691 aa  926    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.57 
 
 		 676 aa  700    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  54.62 
 
 		 692 aa  673    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.43 
 
 		 685 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.67 
 
 		 697 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.21 
 
 		 697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  56.59 
 
 		 699 aa  554  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  45.55 
 
 		 883 aa  547  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.77 
 
 		 699 aa  548  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.82 
 
 		 686 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.16 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  46.01 
 
 		 867 aa  539  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.94 
 
 		 621 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.68 
 
 		 694 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  49.03 
 
 		 648 aa  538  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.23 
 
 		 621 aa  537  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  55.93 
 
 		 706 aa  534  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  45.26 
 
 		 787 aa  534  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  47.68 
 
 		 694 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.14 
 
 		 649 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.02 
 
 		 637 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  54.67 
 
 		 628 aa  528  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  54.27 
 
 		 627 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.17 
 
 		 629 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.67 
 
 		 628 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.47 
 
 		 628 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  52.58 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  52.58 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  46.52 
 
 		 817 aa  524  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  52.58 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.98 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.58 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  52.58 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.58 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  52.78 
 
 		 629 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  52.58 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.78 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.78 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.69 
 
 		 629 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  52.38 
 
 		 632 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  52.58 
 
 		 628 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.54 
 
 		 639 aa  521  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.18 
 
 		 627 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.18 
 
 		 631 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  46.74 
 
 		 639 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.18 
 
 		 631 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  52.05 
 
 		 638 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.61 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.38 
 
 		 653 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.56 
 
 		 621 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.28 
 
 		 614 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  51.61 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.48 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  51.31 
 
 		 641 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 		 634 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.25 
 
 		 639 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.73 
 
 		 640 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  52.19 
 
 		 660 aa  512  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.61 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.54 
 
 		 646 aa  513  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 		 630 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.19 
 
 		 696 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.89 
 
 		 642 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.6 
 
 		 630 aa  510  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.2 
 
 		 638 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  46.06 
 
 		 682 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 		 647 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  45.41 
 
 		 641 aa  510  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.2 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.81 
 
 		 662 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.27 
 
 		 643 aa  511  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.48 
 
 		 652 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.78 
 
 		 627 aa  509  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.19 
 
 		 714 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  51.59 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.81 
 
 		 637 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 650 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  51.59 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  50.28 
 
 		 649 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51.81 
 
 		 626 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.34 
 
 		 615 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.5 
 
 		 635 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  50.4 
 
 		 651 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.28 
 
 		 650 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  51.59 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  50.47 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  51.59 
 
 		 647 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  51.59 
 
 		 647 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  51.59 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  52.17 
 
 		 612 aa  507  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.59 
 
 		 655 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.66 
 
 		 634 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.78 
 
 		 659 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  51.39 
 
 		 650 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>