More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1654 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.34 
 
 		 676 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.21 
 
 		 696 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  57.05 
 
 		 673 aa  707    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  52.54 
 
 		 691 aa  662    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  72.74 
 
 		 691 aa  938    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.94 
 
 		 685 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.34 
 
 		 641 aa  851    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 652 aa  1333    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.42 
 
 		 673 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  55.3 
 
 		 692 aa  700    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 		 697 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.76 
 
 		 697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  48.47 
 
 		 699 aa  567  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  46.94 
 
 		 817 aa  559  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.58 
 
 		 699 aa  557  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 		 686 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.69 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.85 
 
 		 649 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  48.27 
 
 		 694 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  46.38 
 
 		 627 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  45.87 
 
 		 628 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  45.75 
 
 		 632 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  48.1 
 
 		 706 aa  543  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.35 
 
 		 629 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.61 
 
 		 631 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  44.75 
 
 		 629 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.32 
 
 		 621 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.83 
 
 		 628 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  44.83 
 
 		 628 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.04 
 
 		 628 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.34 
 
 		 640 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  44.83 
 
 		 628 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.21 
 
 		 628 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  46.13 
 
 		 867 aa  539  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  44.83 
 
 		 628 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.99 
 
 		 621 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.35 
 
 		 631 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.74 
 
 		 627 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  44.83 
 
 		 628 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.67 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.44 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.67 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.83 
 
 		 628 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  44.83 
 
 		 628 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.44 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  45.15 
 
 		 883 aa  536  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  51.72 
 
 		 641 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.22 
 
 		 629 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  44.88 
 
 		 628 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.92 
 
 		 639 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.33 
 
 		 634 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  51.92 
 
 		 639 aa  534  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.53 
 
 		 639 aa  532  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.74 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  49 
 
 		 648 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.74 
 
 		 637 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 		 638 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.66 
 
 		 638 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.48 
 
 		 639 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 		 630 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.19 
 
 		 655 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  47.19 
 
 		 787 aa  525  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.86 
 
 		 640 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.35 
 
 		 660 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.24 
 
 		 653 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  48.38 
 
 		 658 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.93 
 
 		 648 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.47 
 
 		 645 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  50.47 
 
 		 645 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  46.29 
 
 		 651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.08 
 
 		 627 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.57 
 
 		 602 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  52.19 
 
 		 646 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.93 
 
 		 643 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  43.6 
 
 		 617 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.14 
 
 		 714 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.14 
 
 		 696 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  51.28 
 
 		 639 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  46.67 
 
 		 647 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 647 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  45.63 
 
 		 649 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 630 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  49.71 
 
 		 602 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.79 
 
 		 651 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  46.67 
 
 		 647 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  58.58 
 
 		 476 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.91 
 
 		 647 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  43.8 
 
 		 681 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  46.32 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  44.91 
 
 		 658 aa  508  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  46.49 
 
 		 647 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  45.47 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  50.49 
 
 		 626 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  49.9 
 
 		 608 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  46.32 
 
 		 647 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  47.84 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  46.32 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.54 
 
 		 673 aa  507  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  46.32 
 
 		 647 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>