More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82096 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  52.74 
 
 		 883 aa  753    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  55.88 
 
 		 817 aa  674    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  59.4 
 
 		 867 aa  743    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  100 
 
 		 787 aa  1608    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.85 
 
 		 673 aa  608  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  46.98 
 
 		 691 aa  610  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.88 
 
 		 696 aa  595  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.87 
 
 		 676 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.95 
 
 		 685 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  47.43 
 
 		 692 aa  587  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  47.42 
 
 		 648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.53 
 
 		 697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  51.65 
 
 		 590 aa  550  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  45.53 
 
 		 691 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  57.99 
 
 		 476 aa  539  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.18 
 
 		 697 aa  519  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.55 
 
 		 652 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.8 
 
 		 641 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.62 
 
 		 714 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 696 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.27 
 
 		 686 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.64 
 
 		 699 aa  502  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  50.85 
 
 		 699 aa  500  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.23 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.23 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  44.06 
 
 		 646 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  43.31 
 
 		 673 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.41 
 
 		 694 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.29 
 
 		 639 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  49.81 
 
 		 706 aa  492  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.59 
 
 		 652 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  46.25 
 
 		 641 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  42.39 
 
 		 614 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.62 
 
 		 640 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50 
 
 		 638 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  49.9 
 
 		 645 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.1 
 
 		 639 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.92 
 
 		 676 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  49.03 
 
 		 635 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.19 
 
 		 642 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.9 
 
 		 645 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.08 
 
 		 647 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.02 
 
 		 621 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  50.28 
 
 		 694 aa  489  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.44 
 
 		 639 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  43.27 
 
 		 627 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  47.96 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  46.44 
 
 		 639 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.07 
 
 		 630 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.01 
 
 		 687 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  41.98 
 
 		 608 aa  485  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.08 
 
 		 637 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.21 
 
 		 635 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.73 
 
 		 640 aa  485  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  47.71 
 
 		 659 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.89 
 
 		 639 aa  485  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.89 
 
 		 612 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.65 
 
 		 633 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.04 
 
 		 630 aa  482  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  46.88 
 
 		 692 aa  482  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.39 
 
 		 652 aa  480  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.05 
 
 		 615 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.41 
 
 		 617 aa  482  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.61 
 
 		 644 aa  482  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.89 
 
 		 643 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.39 
 
 		 640 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  48.47 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.4 
 
 		 658 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.29 
 
 		 656 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.12 
 
 		 655 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  43.78 
 
 		 662 aa  476  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.29 
 
 		 645 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.58 
 
 		 651 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.77 
 
 		 662 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.2 
 
 		 653 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  47.36 
 
 		 702 aa  479  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  41.32 
 
 		 629 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  48.43 
 
 		 633 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  47.83 
 
 		 681 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.45 
 
 		 658 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.57 
 
 		 638 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.83 
 
 		 634 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.71 
 
 		 648 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.64 
 
 		 676 aa  479  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  47.55 
 
 		 639 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.36 
 
 		 705 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.17 
 
 		 706 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.34 
 
 		 637 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.52 
 
 		 638 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 		 612 aa  479  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.45 
 
 		 658 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.06 
 
 		 673 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  43.49 
 
 		 634 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  47.72 
 
 		 633 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  47.72 
 
 		 633 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.85 
 
 		 629 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  41.32 
 
 		 628 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  45.79 
 
 		 917 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  48.95 
 
 		 621 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.63 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>