More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2583 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
419 aa  865    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  60.43 
 
 
424 aa  536  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  59.38 
 
 
428 aa  514  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  55.72 
 
 
425 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  49.05 
 
 
427 aa  414  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  45.23 
 
 
425 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  44.47 
 
 
426 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  41.9 
 
 
430 aa  344  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  40.84 
 
 
493 aa  331  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  41.56 
 
 
419 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  40.96 
 
 
459 aa  324  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  39.81 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  38.72 
 
 
468 aa  310  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  39.61 
 
 
451 aa  306  6e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  38.27 
 
 
348 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  35.97 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  37.87 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  36.05 
 
 
363 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.43 
 
 
326 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  38.46 
 
 
322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  34.47 
 
 
332 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  34.47 
 
 
332 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  35.32 
 
 
320 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  33.33 
 
 
322 aa  125  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  36.87 
 
 
459 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  36.48 
 
 
394 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  36.6 
 
 
371 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  39.08 
 
 
366 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  36.18 
 
 
1284 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  40.22 
 
 
810 aa  123  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.98 
 
 
773 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  40.12 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  43.58 
 
 
829 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  34.23 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  31.97 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  35.32 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.46 
 
 
662 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  38.86 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.5 
 
 
755 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  36.84 
 
 
1124 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  32.75 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  39.27 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  33.17 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  35.61 
 
 
645 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  37.11 
 
 
370 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 
367 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0450  Microtubule-severing ATPase  33.2 
 
 
430 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.98 
 
 
704 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40 
 
 
759 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  33.6 
 
 
308 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  34.13 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  36.59 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.32 
 
 
768 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  39.8 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  34.86 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  32.19 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  32.54 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.3 
 
 
757 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  30.38 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 
608 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  37.06 
 
 
338 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  36.84 
 
 
1178 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  28.4 
 
 
328 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  41.01 
 
 
360 aa  117  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.15 
 
 
510 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  36.59 
 
 
431 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  31.93 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  31.93 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  34.45 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  41.34 
 
 
814 aa  116  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  33.47 
 
 
703 aa  116  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  34.68 
 
 
618 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  36.55 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  37.43 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  32.37 
 
 
784 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  32.46 
 
 
1301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  34.45 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  34.67 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  34.24 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.71 
 
 
737 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.13 
 
 
760 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  37.56 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.84 
 
 
739 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.3 
 
 
757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  36.04 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.08 
 
 
723 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.88 
 
 
617 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  31.68 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  33.91 
 
 
323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.29 
 
 
718 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.71 
 
 
738 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  33.91 
 
 
323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  33.48 
 
 
575 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  33.48 
 
 
575 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  33.84 
 
 
336 aa  113  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  34.36 
 
 
437 aa  113  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02925  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 6 (Eurofung)  36.27 
 
 
1476 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.637827  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  36.36 
 
 
699 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  34.41 
 
 
412 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>