More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5976 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  100 
 
 
323 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
323 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  72.29 
 
 
320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  70.66 
 
 
332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  70.66 
 
 
332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  52.83 
 
 
335 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  48.58 
 
 
324 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  49.53 
 
 
338 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  52.73 
 
 
322 aa  299  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  48.11 
 
 
322 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  46.33 
 
 
352 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  47.27 
 
 
366 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  40 
 
 
326 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  44.97 
 
 
391 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 
363 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  31.21 
 
 
348 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  36.68 
 
 
326 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  34.18 
 
 
322 aa  153  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  32.01 
 
 
327 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  33.97 
 
 
328 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  33.97 
 
 
328 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  39.9 
 
 
369 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  37.75 
 
 
387 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  34.53 
 
 
328 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  31.94 
 
 
329 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 
329 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  38.78 
 
 
390 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  37.76 
 
 
388 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  30.23 
 
 
335 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  39.52 
 
 
405 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 
327 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 
327 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  36.76 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  40.49 
 
 
369 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  28.92 
 
 
335 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  36.53 
 
 
327 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  44.81 
 
 
401 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 
328 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  36.96 
 
 
389 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  30.79 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  48.2 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  42.07 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  31.42 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  33.01 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  35.96 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  39 
 
 
367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  36.61 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.27 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  38.17 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  37.71 
 
 
459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  38.68 
 
 
451 aa  126  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  37.74 
 
 
477 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  38.27 
 
 
468 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  39.16 
 
 
328 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  34.51 
 
 
336 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  34.41 
 
 
239 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  42.24 
 
 
345 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  37.05 
 
 
428 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  34.07 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  31.37 
 
 
336 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  32.45 
 
 
330 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  34.6 
 
 
493 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  32.79 
 
 
336 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  32.82 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  37.07 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  33.47 
 
 
426 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  34.17 
 
 
427 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  32.03 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  33.91 
 
 
419 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  36.67 
 
 
430 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  34.45 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  31.82 
 
 
410 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  32.19 
 
 
243 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  45.26 
 
 
425 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.42 
 
 
759 aa  106  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.31 
 
 
769 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  33.94 
 
 
1178 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  36.48 
 
 
607 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  35.05 
 
 
599 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  34.2 
 
 
814 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  30 
 
 
810 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.05 
 
 
731 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.3 
 
 
731 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02925  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 6 (Eurofung)  36.31 
 
 
1476 aa  99.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.637827  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.84 
 
 
810 aa  99.4  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.29 
 
 
731 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  35.57 
 
 
832 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.05 
 
 
739 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.7 
 
 
735 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.11 
 
 
760 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  35 
 
 
406 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.94 
 
 
701 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.48 
 
 
805 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.4 
 
 
731 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.46 
 
 
738 aa  97.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  38.71 
 
 
866 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.78 
 
 
723 aa  96.7  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  34.86 
 
 
804 aa  96.3  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>