More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5696 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 389 aa  779    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  63.06 
 
 		 390 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  64.4 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  61.14 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  61.54 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  44.99 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  45.08 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  38.52 
 
 		 360 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  41.47 
 
 		 405 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  37.91 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  49.08 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 		 363 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  31.1 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  34.8 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  39.91 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.02 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  35.36 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  36.49 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  39.9 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  36.75 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  41.14 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  37.31 
 
 		 328 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  41.94 
 
 		 239 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  35.83 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  40.22 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  32.33 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  37.37 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  32.37 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  32.37 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.15 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  34.45 
 
 		 328 aa  136  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  36.96 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  33.18 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  36.96 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  37.89 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  38.8 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  35.16 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  43.01 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  35.59 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  35.59 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  36.05 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  32.87 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  32.87 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  36.55 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  34.86 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  28.43 
 
 		 327 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  42.21 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  35.75 
 
 		 321 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  41.77 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  34.8 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  34.26 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  36.99 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  35.53 
 
 		 336 aa  124  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  35.38 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  38.21 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  35.62 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  41.14 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  39.49 
 
 		 459 aa  119  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  38.27 
 
 		 426 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  38.27 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  31.68 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  34.04 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  38.38 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  35.23 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  37.36 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  32.98 
 
 		 328 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  38.65 
 
 		 430 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  32.09 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  37.65 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  42.96 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  36.04 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  40.25 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  38.71 
 
 		 613 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  41.32 
 
 		 639 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  40.3 
 
 		 424 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  40.94 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  36.23 
 
 		 601 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  35.06 
 
 		 659 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  36.16 
 
 		 630 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.15 
 
 		 638 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  35.62 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  33.15 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  37.91 
 
 		 829 aa  97.8  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  39.55 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.88 
 
 		 647 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  38.81 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 632 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.73 
 
 		 616 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.78 
 
 		 759 aa  96.7  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  34.78 
 
 		 618 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  39.55 
 
 		 371 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.64 
 
 		 615 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.66 
 
 		 627 aa  96.3  9e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.91 
 
 		 697 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 626 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 646 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.04 
 
 		 615 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.53 
 
 		 637 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.16 
 
 		 662 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>