More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4892 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
326 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  55.35 
 
 
328 aa  378  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  54.11 
 
 
322 aa  346  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  53.46 
 
 
328 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  53.92 
 
 
328 aa  342  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  52.28 
 
 
335 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  52.12 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  51.7 
 
 
328 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  47.38 
 
 
327 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  50.78 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  49.84 
 
 
328 aa  318  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  45.29 
 
 
329 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  51.32 
 
 
336 aa  309  5e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  44.98 
 
 
329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  51.53 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  51.85 
 
 
336 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  50.31 
 
 
330 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  50.31 
 
 
336 aa  298  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  49.38 
 
 
336 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  43.22 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  43.22 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  47.84 
 
 
328 aa  281  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  41.77 
 
 
327 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  44.06 
 
 
321 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  44.14 
 
 
325 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  41.46 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.92 
 
 
326 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  34.49 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  32.93 
 
 
391 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  36.47 
 
 
322 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  35.71 
 
 
324 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  44.57 
 
 
366 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.37 
 
 
348 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.31 
 
 
332 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  36.96 
 
 
332 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  36.96 
 
 
332 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 
320 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  44.64 
 
 
322 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  36.68 
 
 
323 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  36.68 
 
 
323 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.7 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 
352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  34.54 
 
 
335 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  33.2 
 
 
338 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  37.21 
 
 
369 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  39.88 
 
 
387 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  38.73 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  36.42 
 
 
388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  34.67 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  38.15 
 
 
390 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  35.06 
 
 
425 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  27.48 
 
 
370 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  37.61 
 
 
345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  32 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  31.78 
 
 
360 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  36.99 
 
 
389 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  35.06 
 
 
419 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  26.79 
 
 
363 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  32.75 
 
 
419 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  28.39 
 
 
367 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.1 
 
 
493 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  29.69 
 
 
424 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  30.25 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  36.26 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.13 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.1 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  34.44 
 
 
239 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  33.72 
 
 
663 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  30.95 
 
 
427 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  37.38 
 
 
425 aa  116  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  40.61 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  30.24 
 
 
477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  34.63 
 
 
659 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  32.68 
 
 
784 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.57 
 
 
671 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.79 
 
 
669 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  38.38 
 
 
618 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1761  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.17 
 
 
643 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  29.5 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.38 
 
 
666 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.59 
 
 
639 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1261  cell division protein FtsH  35.17 
 
 
640 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.112484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.41 
 
 
666 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.41 
 
 
666 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.41 
 
 
666 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86417  mitochondrial protein of the CDC48/PAS1/SEC18 family of ATPases  36.36 
 
 
703 aa  109  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.41 
 
 
852 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.79 
 
 
687 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  32.83 
 
 
428 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  34.75 
 
 
643 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.47 
 
 
640 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.5 
 
 
697 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.35 
 
 
677 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  31.77 
 
 
430 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  31.35 
 
 
682 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  33.48 
 
 
644 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  33.48 
 
 
647 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  33.05 
 
 
637 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  32.79 
 
 
689 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  32.11 
 
 
437 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>