More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2254 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  100 
 
 		 321 aa  650    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  48 
 
 		 327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  49.08 
 
 		 329 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  49.08 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  48.92 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  50.78 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  50.15 
 
 		 325 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  46.04 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  47.2 
 
 		 327 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  47.2 
 
 		 327 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  46.71 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  47.53 
 
 		 328 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  47.65 
 
 		 328 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  47.69 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  44.05 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  44.95 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  44.24 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  45.12 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  44.06 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  42.6 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  42.37 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  41.19 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  40.56 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  40.06 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  40.12 
 
 		 336 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.82 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  31.13 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  30.82 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  30.89 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  33 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.41 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  34.01 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  34.44 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.39 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  37.63 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  28.52 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  35.38 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  28.3 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  38.65 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 239 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  35.05 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  35.75 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  37.14 
 
 		 390 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  31.15 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  35.26 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  35.91 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  28.38 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  28.79 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.04 
 
 		 428 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.62 
 
 		 425 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  29.27 
 
 		 430 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  34.07 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  34.07 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  28.37 
 
 		 360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  33.79 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  32.19 
 
 		 419 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  31.36 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  29.43 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  30.8 
 
 		 419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  30.43 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  28.81 
 
 		 477 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  31.82 
 
 		 355 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.2 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  29.43 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  29.43 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  29.75 
 
 		 451 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  28.52 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  27.98 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  30.54 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  27.16 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  27.16 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  30.21 
 
 		 372 aa  109  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  28.27 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  35.41 
 
 		 810 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  30.26 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  32.08 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  35.29 
 
 		 804 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  28.42 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  25.95 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  33.18 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  31.42 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  30.17 
 
 		 1284 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  31.89 
 
 		 803 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  34.74 
 
 		 501 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1253  ATPase of the AAA+ class  30.51 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.228629  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  30.92 
 
 		 379 aa  99.4  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  32.6 
 
 		 371 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  31.02 
 
 		 1301 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.3 
 
 		 784 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  31.28 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  32.68 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  29.21 
 
 		 442 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.82 
 
 		 709 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.49 
 
 		 781 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  29.85 
 
 		 503 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.89 
 
 		 800 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  29.7 
 
 		 507 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>