More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3852 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 335 aa  681    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  94.93 
 
 		 335 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  55.05 
 
 		 322 aa  355  6.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  52.12 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  52.02 
 
 		 328 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  49.24 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  51.68 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  52.29 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  46.99 
 
 		 327 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  45.21 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  45.21 
 
 		 329 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  48.78 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  47.8 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  47.11 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  46.5 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  46.48 
 
 		 327 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  46.48 
 
 		 327 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  45.26 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  44.05 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  45.57 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  42.51 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  43.38 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  44.06 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  44.98 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  44.06 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  34.33 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.76 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  35.78 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.43 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  38.31 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.81 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.69 
 
 		 391 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  28.88 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  33.09 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  30.95 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  30.95 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  30.95 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  33.71 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.13 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  32.94 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  32.99 
 
 		 369 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  36.9 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  31.09 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  34.98 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  28.92 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  28.92 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.2 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  36.41 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  32.49 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  39.18 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  37.14 
 
 		 387 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  33.21 
 
 		 468 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  29.39 
 
 		 360 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  35.16 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  35.43 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  34.07 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.05 
 
 		 451 aa  126  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.42 
 
 		 459 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.59 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  36.32 
 
 		 239 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  29.21 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.98 
 
 		 477 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.66 
 
 		 425 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  31.8 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  31.5 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  31.8 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  28.57 
 
 		 370 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  32.26 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  30.22 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  31.78 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  29.31 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  28.11 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  31.45 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  28.8 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  35.38 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  34.58 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.05 
 
 		 651 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  30.19 
 
 		 599 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  25.83 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  33.83 
 
 		 804 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2075  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.04 
 
 		 621 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000894512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  34.09 
 
 		 810 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.88 
 
 		 760 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  39.51 
 
 		 643 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  39.02 
 
 		 649 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.02 
 
 		 654 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1832  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 		 623 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.84 
 
 		 718 aa  102  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.02 
 
 		 651 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.54 
 
 		 650 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  39.02 
 
 		 644 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.02 
 
 		 647 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  39.02 
 
 		 647 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  39.02 
 
 		 644 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  39.02 
 
 		 644 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  39.02 
 
 		 644 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.5 
 
 		 621 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  39.02 
 
 		 647 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  39.02 
 
 		 647 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.47 
 
 		 640 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>