More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0634 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  73.97 
 
 
607 aa  885    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
599 aa  1214    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.62 
 
 
736 aa  429  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.94 
 
 
727 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.3 
 
 
731 aa  422  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.41 
 
 
731 aa  423  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.05 
 
 
759 aa  419  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.11 
 
 
719 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.47 
 
 
732 aa  419  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.78 
 
 
731 aa  421  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.15 
 
 
731 aa  418  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.09 
 
 
735 aa  416  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.65 
 
 
737 aa  413  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.83 
 
 
718 aa  413  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.87 
 
 
760 aa  411  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.34 
 
 
737 aa  410  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.99 
 
 
738 aa  409  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.44 
 
 
768 aa  396  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.68 
 
 
753 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.15 
 
 
852 aa  391  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.71 
 
 
723 aa  392  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.66 
 
 
721 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.54 
 
 
709 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.67 
 
 
715 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  39.21 
 
 
703 aa  388  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.23 
 
 
739 aa  388  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.97 
 
 
756 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.33 
 
 
701 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.53 
 
 
769 aa  382  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.69 
 
 
757 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.53 
 
 
736 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.86 
 
 
738 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.04 
 
 
740 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  36.87 
 
 
754 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  39.19 
 
 
763 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  39.48 
 
 
764 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  39.64 
 
 
722 aa  374  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.1 
 
 
742 aa  374  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  39.02 
 
 
829 aa  375  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.53 
 
 
754 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.3 
 
 
754 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.6 
 
 
738 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.87 
 
 
754 aa  368  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.08 
 
 
743 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  39.07 
 
 
718 aa  369  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.02 
 
 
808 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.11 
 
 
730 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  38.27 
 
 
732 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.2 
 
 
740 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  40.5 
 
 
739 aa  364  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  37.96 
 
 
814 aa  363  6e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.27 
 
 
806 aa  362  9e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  37.79 
 
 
810 aa  362  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.89 
 
 
704 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37 
 
 
773 aa  361  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.45 
 
 
757 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  38.85 
 
 
806 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  36.1 
 
 
713 aa  360  3e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.61 
 
 
742 aa  359  8e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  37.7 
 
 
804 aa  359  9e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.04 
 
 
754 aa  359  9e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.78 
 
 
757 aa  359  9e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  38.64 
 
 
810 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.56 
 
 
772 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  37.09 
 
 
639 aa  357  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.41 
 
 
801 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.08 
 
 
763 aa  355  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.88 
 
 
755 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  35.44 
 
 
721 aa  355  2e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.59 
 
 
781 aa  350  4e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.25 
 
 
804 aa  348  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.18 
 
 
810 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.11 
 
 
805 aa  347  5e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.4 
 
 
805 aa  346  6e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.55 
 
 
784 aa  346  8e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  37.43 
 
 
613 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.14 
 
 
801 aa  343  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.54 
 
 
781 aa  343  5e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  36.61 
 
 
699 aa  342  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  39.22 
 
 
746 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  38.24 
 
 
647 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  38.87 
 
 
601 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  36.69 
 
 
703 aa  334  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  35.16 
 
 
775 aa  333  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  36.52 
 
 
776 aa  332  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  36.18 
 
 
585 aa  329  7e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  36.63 
 
 
866 aa  321  3e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  33.58 
 
 
788 aa  317  4e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  35.35 
 
 
930 aa  313  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  34.32 
 
 
685 aa  312  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  34.78 
 
 
567 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  34.08 
 
 
832 aa  306  5.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  33.4 
 
 
803 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  34.7 
 
 
550 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  35.24 
 
 
691 aa  303  5.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
826 aa  302  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  35.1 
 
 
756 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  33.16 
 
 
729 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  33.08 
 
 
552 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40257  predicted protein  34.25 
 
 
537 aa  253  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>