More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0001 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
866 aa  1744    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  42.33 
 
 
703 aa  361  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.06 
 
 
754 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.19 
 
 
757 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.68 
 
 
754 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.11 
 
 
739 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.41 
 
 
743 aa  350  7e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.18 
 
 
754 aa  350  8e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.18 
 
 
740 aa  349  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.23 
 
 
742 aa  348  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.96 
 
 
759 aa  348  3e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.21 
 
 
763 aa  345  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.3 
 
 
754 aa  346  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.64 
 
 
732 aa  345  1e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.41 
 
 
742 aa  345  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.87 
 
 
740 aa  345  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.27 
 
 
718 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.71 
 
 
760 aa  342  2e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  37.65 
 
 
713 aa  341  4e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.82 
 
 
735 aa  340  7e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  34.84 
 
 
763 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.09 
 
 
731 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.45 
 
 
768 aa  337  5e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.43 
 
 
731 aa  337  7.999999999999999e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.06 
 
 
731 aa  336  1e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  38.55 
 
 
739 aa  334  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.7 
 
 
731 aa  335  3e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  35.02 
 
 
764 aa  333  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.51 
 
 
736 aa  333  6e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.76 
 
 
737 aa  332  2e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.54 
 
 
723 aa  330  8e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.86 
 
 
727 aa  329  1.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.27 
 
 
738 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.94 
 
 
756 aa  326  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.62 
 
 
769 aa  324  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.24 
 
 
738 aa  323  6e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  33.09 
 
 
829 aa  323  7e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  36.33 
 
 
814 aa  323  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  34.24 
 
 
804 aa  323  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.36 
 
 
737 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  40.67 
 
 
699 aa  323  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
810 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.12 
 
 
704 aa  320  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  33.83 
 
 
810 aa  319  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.31 
 
 
757 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.8 
 
 
719 aa  318  4e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.58 
 
 
755 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.13 
 
 
757 aa  317  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  35.88 
 
 
754 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  34.39 
 
 
732 aa  316  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.7 
 
 
808 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.48 
 
 
721 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.53 
 
 
736 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  38.63 
 
 
746 aa  314  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  32.98 
 
 
806 aa  313  7.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.74 
 
 
730 aa  313  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.46 
 
 
738 aa  313  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  36.63 
 
 
599 aa  312  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.22 
 
 
805 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.36 
 
 
701 aa  310  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  32.81 
 
 
775 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.57 
 
 
715 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.08 
 
 
772 aa  307  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.15 
 
 
805 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  33.99 
 
 
722 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  34.89 
 
 
718 aa  304  5.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  34.89 
 
 
703 aa  303  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  36.33 
 
 
776 aa  303  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  32.26 
 
 
721 aa  302  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.89 
 
 
806 aa  303  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  32.97 
 
 
607 aa  301  2e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.95 
 
 
810 aa  297  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.44 
 
 
753 aa  296  8e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.98 
 
 
773 aa  296  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  35.58 
 
 
613 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  33.73 
 
 
691 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  35.98 
 
 
550 aa  294  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  31.55 
 
 
685 aa  293  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.4 
 
 
852 aa  291  5.0000000000000004e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  32.52 
 
 
788 aa  290  6e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.26 
 
 
804 aa  290  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  34.14 
 
 
803 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  34.01 
 
 
639 aa  288  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  35.1 
 
 
826 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  32.26 
 
 
832 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  35.03 
 
 
601 aa  284  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.61 
 
 
709 aa  281  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.86 
 
 
801 aa  278  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  31.27 
 
 
729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  33.14 
 
 
930 aa  271  5e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  31.83 
 
 
756 aa  265  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  33.08 
 
 
647 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.33 
 
 
801 aa  261  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 
585 aa  259  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  34.22 
 
 
567 aa  248  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  34.57 
 
 
748 aa  241  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  35.06 
 
 
747 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  32.96 
 
 
749 aa  233  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  34.08 
 
 
750 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  30.59 
 
 
552 aa  224  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>