More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7319 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
355 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  34.63 
 
 
363 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  37.65 
 
 
367 aa  189  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  34.57 
 
 
370 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  34.84 
 
 
401 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  32.69 
 
 
390 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  43.3 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  38.96 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 
388 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  34.53 
 
 
387 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  34.29 
 
 
369 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  37.6 
 
 
369 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  33.23 
 
 
325 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  33.96 
 
 
345 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  39.33 
 
 
326 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  37.39 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  38.76 
 
 
322 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  34.2 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  43.52 
 
 
323 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  43.52 
 
 
323 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  46.04 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  46.04 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  37.67 
 
 
320 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  37.17 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  36.21 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  43.48 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  49.62 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  33.64 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  45.77 
 
 
352 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  33.48 
 
 
322 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  41.72 
 
 
366 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  34.33 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  32.85 
 
 
335 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  35.12 
 
 
328 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  37.24 
 
 
322 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  30.99 
 
 
328 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  36.81 
 
 
328 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.23 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  31.4 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  36.69 
 
 
328 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  31.17 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.59 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  34.43 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  35.75 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  36.26 
 
 
326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  31.82 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  35.43 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  42.2 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  39.44 
 
 
332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  42.65 
 
 
239 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  33.93 
 
 
459 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  30.36 
 
 
325 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  37.29 
 
 
336 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  34.5 
 
 
493 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  37.44 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  35.76 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  36.51 
 
 
477 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  36.99 
 
 
336 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  31.72 
 
 
430 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  38.05 
 
 
428 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  31.55 
 
 
328 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  37.71 
 
 
426 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 
332 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  36.36 
 
 
451 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  32.31 
 
 
243 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  36.17 
 
 
424 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  34.54 
 
 
468 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  38.37 
 
 
419 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  36.6 
 
 
425 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  39.44 
 
 
351 aa  103  5e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  38.71 
 
 
419 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.82 
 
 
738 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
743 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.03 
 
 
723 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  31.6 
 
 
814 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
742 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.77 
 
 
775 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  32.8 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.75 
 
 
742 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.27 
 
 
740 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  31.94 
 
 
426 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.04 
 
 
739 aa  96.3  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.39 
 
 
781 aa  96.3  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35 
 
 
760 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.36 
 
 
756 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.98 
 
 
759 aa  94.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  32.39 
 
 
722 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  35.45 
 
 
652 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.14 
 
 
784 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  28.2 
 
 
651 aa  94  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.5 
 
 
800 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  34.39 
 
 
776 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.78 
 
 
805 aa  93.6  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  34.2 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  28.83 
 
 
744 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>