More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2298 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  700    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  52.67 
 
 
405 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  44.9 
 
 
369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  39.63 
 
 
369 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  53.66 
 
 
390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  53.23 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  52.76 
 
 
325 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  51.52 
 
 
388 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  49.08 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  36.61 
 
 
370 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  39.22 
 
 
360 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  38.34 
 
 
391 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  35.5 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  37.9 
 
 
326 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  38.72 
 
 
348 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  34.16 
 
 
355 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  33.04 
 
 
363 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  34.02 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  36.75 
 
 
401 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  36.86 
 
 
335 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  41.54 
 
 
388 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  31.34 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  38.21 
 
 
328 aa  146  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  41.03 
 
 
328 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  37.61 
 
 
326 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  35.83 
 
 
322 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  33.91 
 
 
329 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  34.21 
 
 
329 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  35.05 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  41.92 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  41.82 
 
 
328 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  42.33 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  34.07 
 
 
335 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  34.7 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  36.57 
 
 
328 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  35.24 
 
 
327 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  35.24 
 
 
327 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  37.63 
 
 
338 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  34.58 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  45.33 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  42.59 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  37.96 
 
 
328 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  33.05 
 
 
335 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  40.72 
 
 
322 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  37.57 
 
 
324 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  42.24 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  42.24 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  39.88 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  39.88 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  40.46 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  40.74 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  39.08 
 
 
430 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  42.33 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  37.8 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  39.18 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  38.6 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  35.94 
 
 
335 aa  126  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  39.88 
 
 
336 aa  126  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  38.6 
 
 
330 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  36.1 
 
 
419 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.44 
 
 
425 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  33.18 
 
 
308 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  38.6 
 
 
336 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  35.14 
 
 
477 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  35.14 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  35.32 
 
 
493 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  37.02 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  36.21 
 
 
468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  35.78 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  33.94 
 
 
426 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  39.89 
 
 
427 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  41.08 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  40.28 
 
 
424 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  37.42 
 
 
243 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  40.26 
 
 
419 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.87 
 
 
723 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  31.73 
 
 
632 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  39.74 
 
 
639 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
781 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
781 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
784 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.82 
 
 
800 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  39.74 
 
 
613 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  36.91 
 
 
776 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  31.68 
 
 
930 aa  97.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  34.21 
 
 
673 aa  97.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  30.29 
 
 
667 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.5 
 
 
759 aa  96.7  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1023  peptidase M41  30.95 
 
 
547 aa  96.7  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  25.36 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  33.94 
 
 
601 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.54 
 
 
685 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  31.12 
 
 
713 aa  95.9  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  31.68 
 
 
464 aa  95.9  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  33.89 
 
 
478 aa  95.9  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  37.84 
 
 
599 aa  95.9  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.89 
 
 
639 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.72 
 
 
760 aa  95.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  30.77 
 
 
628 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
666 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>