More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3136 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 478 aa  986    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  42.6 
 
 		 432 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  40.09 
 
 		 478 aa  342  7e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  40.35 
 
 		 448 aa  338  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  40.75 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  39.87 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  42.86 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  38.27 
 
 		 450 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  37.72 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  41.97 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  39.05 
 
 		 434 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  37.77 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  38.83 
 
 		 441 aa  270  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  47.11 
 
 		 619 aa  217  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  43.68 
 
 		 743 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  45.09 
 
 		 787 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  47.3 
 
 		 652 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  44.66 
 
 		 689 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  48.2 
 
 		 788 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  41.25 
 
 		 749 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  46.36 
 
 		 698 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  45.54 
 
 		 680 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  45.45 
 
 		 671 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  39.85 
 
 		 725 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  43.57 
 
 		 682 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  46.19 
 
 		 657 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  43.78 
 
 		 697 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  45.45 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  42.21 
 
 		 639 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  45.74 
 
 		 653 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  48.44 
 
 		 725 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  39.51 
 
 		 744 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  41.63 
 
 		 656 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  44.81 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  41.7 
 
 		 634 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  36.15 
 
 		 1085 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  43.05 
 
 		 656 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  43.05 
 
 		 665 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  41.67 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  41.67 
 
 		 687 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  42.11 
 
 		 662 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  38.24 
 
 		 646 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  40.34 
 
 		 697 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  40.87 
 
 		 622 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  58.73 
 
 		 134 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  39.21 
 
 		 678 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  34.85 
 
 		 1193 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  35.16 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.8 
 
 		 299 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  34.48 
 
 		 577 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  31.25 
 
 		 570 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  30.86 
 
 		 570 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  30.86 
 
 		 570 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  34.17 
 
 		 569 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  34.7 
 
 		 578 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  32.03 
 
 		 580 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  34.38 
 
 		 617 aa  127  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  33.06 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  32.22 
 
 		 305 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  37.36 
 
 		 228 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  36.45 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  35.27 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  37.33 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  36.32 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  34.15 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  35.08 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  34.78 
 
 		 428 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  34.86 
 
 		 328 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  36.18 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  34.98 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  30.3 
 
 		 328 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  31.75 
 
 		 393 aa  100  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  30.04 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  30.49 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  29.34 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.86 
 
 		 348 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  28.46 
 
 		 326 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.3 
 
 		 308 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  33.81 
 
 		 410 aa  97.4  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  34.45 
 
 		 424 aa  97.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  32.23 
 
 		 427 aa  97.4  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  30.04 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  31.31 
 
 		 369 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  35.1 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  33.18 
 
 		 403 aa  96.7  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  32.7 
 
 		 407 aa  97.1  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 795 aa  96.7  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  31.16 
 
 		 753 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  29.66 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  33.17 
 
 		 414 aa  95.9  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  37.5 
 
 		 360 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.52 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  31.65 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  30.92 
 
 		 321 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  32.49 
 
 		 328 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.81 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  35.94 
 
 		 956 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 		 327 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>