More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1023 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1023  peptidase M41  100 
 
 		 547 aa  1111    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1262  AAA ATPase central domain protein  44.55 
 
 		 553 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.610508  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1351  M41 family peptidase  47.83 
 
 		 558 aa  420  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000179169  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1068  putative cell division protease FtsH-like protein  43.79 
 
 		 556 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.427704  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0699  cell division protein FtsH  42.22 
 
 		 532 aa  412  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0857  atpase ec atp-dependent Zn protease  41.44 
 
 		 556 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  42.62 
 
 		 538 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  42.42 
 
 		 538 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1085  cell division protein FtsH, putative  42.42 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1071  putative cell division protease FtsH-like protein  43.15 
 
 		 561 aa  375  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  35.82 
 
 		 614 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.68 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.13 
 
 		 612 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  34.71 
 
 		 616 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.91 
 
 		 647 aa  316  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.86 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.79 
 
 		 621 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.45 
 
 		 652 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.38 
 
 		 601 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  37.33 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.63 
 
 		 640 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.55 
 
 		 629 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.62 
 
 		 673 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.45 
 
 		 647 aa  310  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.49 
 
 		 639 aa  309  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  35.55 
 
 		 629 aa  309  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 		 601 aa  309  9e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.12 
 
 		 617 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  34.36 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  36.98 
 
 		 608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  36.47 
 
 		 641 aa  307  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.47 
 
 		 641 aa  307  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.01 
 
 		 640 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.39 
 
 		 616 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.69 
 
 		 628 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.37 
 
 		 629 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.85 
 
 		 682 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  37.55 
 
 		 626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  38.08 
 
 		 628 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.05 
 
 		 638 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.24 
 
 		 660 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.69 
 
 		 628 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 		 627 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.39 
 
 		 652 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.12 
 
 		 630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.69 
 
 		 628 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.67 
 
 		 610 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  34.77 
 
 		 650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.71 
 
 		 631 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.49 
 
 		 640 aa  304  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.55 
 
 		 638 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.45 
 
 		 638 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.83 
 
 		 642 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  36.49 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  36.49 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  36.49 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  35.1 
 
 		 632 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  36.49 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.1 
 
 		 638 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  36.58 
 
 		 640 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  36.49 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.95 
 
 		 638 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.49 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.49 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  36.29 
 
 		 628 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.28 
 
 		 639 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  35.28 
 
 		 639 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.31 
 
 		 628 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.96 
 
 		 616 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  34.72 
 
 		 627 aa  302  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  37.61 
 
 		 640 aa  302  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  38.92 
 
 		 639 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  36.27 
 
 		 641 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.86 
 
 		 649 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.09 
 
 		 632 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.05 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.22 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  38.98 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.76 
 
 		 634 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  35.38 
 
 		 628 aa  301  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.76 
 
 		 640 aa  301  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  37.5 
 
 		 637 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.55 
 
 		 638 aa  301  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.76 
 
 		 630 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.33 
 
 		 634 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.33 
 
 		 643 aa  300  5e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.23 
 
 		 639 aa  300  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.71 
 
 		 631 aa  300  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 		 640 aa  300  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  38.99 
 
 		 659 aa  299  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.71 
 
 		 640 aa  299  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.55 
 
 		 650 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  37.21 
 
 		 638 aa  299  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.57 
 
 		 642 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.3 
 
 		 630 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.99 
 
 		 631 aa  299  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>