More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1068 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1351  M41 family peptidase  77.9 
 
 
558 aa  848    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000179169  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1068  putative cell division protease FtsH-like protein  100 
 
 
556 aa  1113    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.427704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0857  atpase ec atp-dependent Zn protease  56.47 
 
 
556 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1262  AAA ATPase central domain protein  54.46 
 
 
553 aa  594  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.610508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  55.98 
 
 
538 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1085  cell division protein FtsH, putative  59.96 
 
 
538 aa  548  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0699  cell division protein FtsH  52.94 
 
 
532 aa  543  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  56.88 
 
 
538 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1071  putative cell division protease FtsH-like protein  53.85 
 
 
561 aa  523  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1023  peptidase M41  42.33 
 
 
547 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.57 
 
 
652 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.62 
 
 
647 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  38.01 
 
 
611 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.93 
 
 
640 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.45 
 
 
671 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.82 
 
 
610 aa  326  6e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.77 
 
 
639 aa  326  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.47 
 
 
617 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.75 
 
 
607 aa  323  7e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.09 
 
 
614 aa  323  7e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.78 
 
 
676 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  37.22 
 
 
614 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  37.64 
 
 
608 aa  320  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.99 
 
 
714 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.99 
 
 
696 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.87 
 
 
626 aa  319  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.22 
 
 
601 aa  319  7e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.31 
 
 
612 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.58 
 
 
636 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.07 
 
 
612 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.95 
 
 
635 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.62 
 
 
643 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.88 
 
 
652 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.46 
 
 
663 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.46 
 
 
663 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.7 
 
 
630 aa  317  5e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2307  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.8 
 
 
599 aa  317  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0665193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1916  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.8 
 
 
598 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.78 
 
 
760 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.59 
 
 
641 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.16 
 
 
639 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.5 
 
 
656 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  36.09 
 
 
629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.64 
 
 
601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.5 
 
 
630 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  35.25 
 
 
616 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36 
 
 
637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.2 
 
 
629 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.34 
 
 
646 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.4 
 
 
636 aa  313  3.9999999999999997e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36 
 
 
629 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.68 
 
 
617 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  46.76 
 
 
646 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  35.98 
 
 
632 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.34 
 
 
646 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 
641 aa  312  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  38.19 
 
 
617 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.72 
 
 
637 aa  312  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.54 
 
 
643 aa  312  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  36.09 
 
 
628 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.33 
 
 
631 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.98 
 
 
627 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.98 
 
 
631 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.67 
 
 
673 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.98 
 
 
631 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.68 
 
 
634 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 
628 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  35.92 
 
 
628 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  46.93 
 
 
663 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.56 
 
 
640 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  35.92 
 
 
628 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  35.92 
 
 
628 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  35.92 
 
 
628 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.54 
 
 
615 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 
628 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.57 
 
 
610 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  35.92 
 
 
628 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.66 
 
 
759 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.69 
 
 
631 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  40.76 
 
 
613 aa  310  2.9999999999999997e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  44.56 
 
 
646 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.18 
 
 
630 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.57 
 
 
610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.69 
 
 
631 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.68 
 
 
642 aa  310  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.24 
 
 
616 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.51 
 
 
640 aa  309  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  35.68 
 
 
665 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.33 
 
 
647 aa  309  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.51 
 
 
612 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  36.4 
 
 
640 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.72 
 
 
650 aa  309  8e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  42.34 
 
 
628 aa  309  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.48 
 
 
607 aa  309  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.62 
 
 
635 aa  309  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.01 
 
 
659 aa  309  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.07 
 
 
608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.37 
 
 
642 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.23 
 
 
634 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  44.47 
 
 
652 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>