More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1916 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  55.79 
 
 
614 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.55 
 
 
612 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.85 
 
 
617 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.88 
 
 
612 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.29 
 
 
621 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  56.61 
 
 
608 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2307  ATP-dependent metalloprotease FtsH  97.79 
 
 
599 aa  1168    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0665193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1916  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
598 aa  1211    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.67 
 
 
635 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.09 
 
 
652 aa  615  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.24 
 
 
641 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  53.24 
 
 
641 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
637 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.78 
 
 
665 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  49.92 
 
 
649 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.61 
 
 
671 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  51.16 
 
 
638 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.12 
 
 
656 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.76 
 
 
676 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
631 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  50.17 
 
 
643 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
654 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
630 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  49.5 
 
 
644 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.5 
 
 
647 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  53.64 
 
 
626 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  49.5 
 
 
644 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  49.5 
 
 
647 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  50.66 
 
 
616 aa  591  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  49.83 
 
 
644 aa  591  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 
650 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  49.5 
 
 
644 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  49.5 
 
 
647 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  49.5 
 
 
647 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  49.5 
 
 
644 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  49.33 
 
 
647 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  49.92 
 
 
647 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  49.16 
 
 
647 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  49.92 
 
 
644 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.93 
 
 
636 aa  586  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.41 
 
 
651 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  49.16 
 
 
647 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  49.16 
 
 
647 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  49.16 
 
 
647 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  48.99 
 
 
647 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.13 
 
 
631 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  52.95 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  52.95 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  49.75 
 
 
647 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  52.95 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  52.95 
 
 
632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.77 
 
 
631 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  52.95 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  53.13 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  50 
 
 
658 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  50 
 
 
660 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  52.95 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.09 
 
 
640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 
631 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 
631 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.77 
 
 
631 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
637 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.41 
 
 
641 aa  579  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.92 
 
 
630 aa  580  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 
629 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  48.59 
 
 
651 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  48.75 
 
 
660 aa  581  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.68 
 
 
629 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  52.68 
 
 
629 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.77 
 
 
627 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
656 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.68 
 
 
634 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
657 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
634 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.72 
 
 
643 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.24 
 
 
647 aa  578  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  50.92 
 
 
634 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  51.34 
 
 
639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  51.34 
 
 
639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  50.59 
 
 
634 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 
637 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  50.67 
 
 
642 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.02 
 
 
631 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  50.67 
 
 
639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.23 
 
 
673 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  49.83 
 
 
659 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.58 
 
 
647 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  49.42 
 
 
641 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.17 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 
621 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  50.17 
 
 
637 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  49.75 
 
 
639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  51.08 
 
 
650 aa  575  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.08 
 
 
660 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  51.52 
 
 
627 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.19 
 
 
659 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>