More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0529 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  100 
 
 
426 aa  859    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  67.54 
 
 
430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  56.59 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  52.97 
 
 
459 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 
468 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  51.1 
 
 
419 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  49.54 
 
 
493 aa  405  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  52 
 
 
451 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  49.43 
 
 
477 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  48.66 
 
 
428 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  44.47 
 
 
419 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 
424 aa  358  8e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  42.75 
 
 
425 aa  320  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  42.28 
 
 
427 aa  317  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  38.86 
 
 
348 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  36.29 
 
 
394 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  35.43 
 
 
426 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  34.41 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.67 
 
 
662 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  37.28 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  33.06 
 
 
363 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  34.63 
 
 
620 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  35.29 
 
 
387 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.57 
 
 
737 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 
459 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  36.1 
 
 
621 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  34.24 
 
 
619 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  33.74 
 
 
431 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  35.57 
 
 
393 aa  137  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.57 
 
 
738 aa  137  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.39 
 
 
636 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  35.64 
 
 
613 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  33.85 
 
 
624 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  37.61 
 
 
436 aa  136  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  35.12 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  35.98 
 
 
614 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.65 
 
 
737 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  33.46 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.75 
 
 
718 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.48 
 
 
612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.02 
 
 
736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  35.27 
 
 
625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.25 
 
 
625 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.48 
 
 
612 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  37.56 
 
 
814 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  34.9 
 
 
663 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  36.53 
 
 
866 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.07 
 
 
739 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  34.58 
 
 
784 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  35.86 
 
 
641 aa  133  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  37.33 
 
 
639 aa  133  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  34.5 
 
 
629 aa  133  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  35.74 
 
 
407 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.8 
 
 
644 aa  133  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.8 
 
 
757 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.69 
 
 
735 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  35.32 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  33.62 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
601 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  34.41 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  35.32 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.06 
 
 
732 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.93 
 
 
769 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  34.63 
 
 
635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  34.36 
 
 
627 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.85 
 
 
673 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.86 
 
 
755 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.85 
 
 
673 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.98 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.5 
 
 
649 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.46 
 
 
618 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.93 
 
 
731 aa  131  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  34.6 
 
 
611 aa  130  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  35.29 
 
 
447 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.56 
 
 
631 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.15 
 
 
638 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  33.33 
 
 
429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.15 
 
 
631 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  33.87 
 
 
1124 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  34.17 
 
 
641 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.15 
 
 
631 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  35.15 
 
 
632 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.06 
 
 
731 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.15 
 
 
627 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.73 
 
 
631 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.15 
 
 
631 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.15 
 
 
631 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  31.67 
 
 
464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.73 
 
 
628 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.73 
 
 
629 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  34.73 
 
 
628 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  34.66 
 
 
648 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  34.73 
 
 
628 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  35.15 
 
 
608 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  34.73 
 
 
628 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  35.18 
 
 
623 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  34.73 
 
 
628 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  31.98 
 
 
584 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.91 
 
 
659 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>