More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1017 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  877    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  51.31 
 
 
428 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  50.84 
 
 
424 aa  431  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  49.05 
 
 
419 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  46.53 
 
 
425 aa  378  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  42.28 
 
 
426 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  40.72 
 
 
425 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 
468 aa  310  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  41.31 
 
 
419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  42.38 
 
 
451 aa  297  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  40.09 
 
 
430 aa  296  4e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  40.27 
 
 
493 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  40.85 
 
 
459 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  39.5 
 
 
477 aa  289  7e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.02 
 
 
348 aa  146  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  35.12 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  41.62 
 
 
322 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  39.06 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  39.06 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 
320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  35.84 
 
 
623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  36.32 
 
 
695 aa  127  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.56 
 
 
697 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.56 
 
 
697 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36 
 
 
632 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  37.14 
 
 
322 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.21 
 
 
723 aa  124  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.56 
 
 
635 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  37.63 
 
 
473 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  38.92 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  34.32 
 
 
814 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  39.58 
 
 
514 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  33.47 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  35.98 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.11 
 
 
639 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 
646 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  34.22 
 
 
700 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.25 
 
 
737 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 
646 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  36.32 
 
 
363 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  34.8 
 
 
624 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  36.19 
 
 
459 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.33 
 
 
662 aa  119  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.82 
 
 
768 aa  119  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.56 
 
 
667 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  34.67 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  34.67 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  34.67 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  34.67 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  34.67 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.44 
 
 
660 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  35.24 
 
 
621 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  34.67 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  34.67 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.51 
 
 
326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  34.22 
 
 
633 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.22 
 
 
633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  34.36 
 
 
620 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  34.67 
 
 
633 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  34.36 
 
 
625 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3258  AAA ATPase central domain protein  38.1 
 
 
412 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69388  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  36.74 
 
 
617 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.73 
 
 
738 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  37.37 
 
 
426 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.28 
 
 
623 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.98 
 
 
760 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.25 
 
 
781 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  34.36 
 
 
619 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  30.43 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  34.6 
 
 
393 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.2 
 
 
742 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.87 
 
 
739 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.95 
 
 
602 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.33 
 
 
775 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.19 
 
 
663 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  34.17 
 
 
323 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  32.26 
 
 
335 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.97 
 
 
608 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  34.17 
 
 
323 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.56 
 
 
608 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.53 
 
 
627 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.09 
 
 
737 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  30.95 
 
 
326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.46 
 
 
742 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.76 
 
 
738 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.2 
 
 
754 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  35.74 
 
 
499 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  32.92 
 
 
810 aa  116  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  38.3 
 
 
832 aa  116  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  38.59 
 
 
756 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  36.28 
 
 
617 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  37.24 
 
 
615 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  36.28 
 
 
617 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.18 
 
 
611 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  33.62 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  39.31 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2330  AAA ATPase central domain protein  32.9 
 
 
458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.11 
 
 
639 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0857  atpase ec atp-dependent Zn protease  36.07 
 
 
556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  36.45 
 
 
619 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>