More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1958 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 468 aa  942    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  67.4 
 
 		 493 aa  612  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  69.16 
 
 		 459 aa  601  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  68.4 
 
 		 477 aa  578  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  64.67 
 
 		 451 aa  558  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  50 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  48.62 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  49.88 
 
 		 425 aa  388  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  46.63 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  42.55 
 
 		 428 aa  336  7e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  41.37 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  40 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  38.72 
 
 		 419 aa  310  5e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  41.01 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.63 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  35.23 
 
 		 639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  35.08 
 
 		 394 aa  147  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  35.83 
 
 		 613 aa  146  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  36.33 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.3 
 
 		 602 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  38.5 
 
 		 814 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  30.63 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  35.34 
 
 		 619 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.61 
 
 		 737 aa  141  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.61 
 
 		 737 aa  141  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  34.94 
 
 		 620 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  33.33 
 
 		 630 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  31.22 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.92 
 
 		 736 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  37.55 
 
 		 641 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  35.14 
 
 		 648 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.92 
 
 		 738 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.69 
 
 		 718 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  38.25 
 
 		 775 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  34.36 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  35.74 
 
 		 629 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  35.37 
 
 		 621 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.65 
 
 		 625 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.81 
 
 		 739 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  34.36 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  33.98 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  35.25 
 
 		 623 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  34.78 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  34.54 
 
 		 624 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  34.66 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.29 
 
 		 735 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.82 
 
 		 643 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  40.64 
 
 		 729 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.3 
 
 		 793 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  33.61 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  39.15 
 
 		 866 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.86 
 
 		 723 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  35.93 
 
 		 601 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  34.22 
 
 		 832 aa  136  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  32.22 
 
 		 398 aa  136  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  34.94 
 
 		 625 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  35.34 
 
 		 620 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.84 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  34.91 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.73 
 
 		 673 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1761  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.73 
 
 		 643 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.55 
 
 		 639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  34.94 
 
 		 620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  34.14 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.15 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  35.27 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.73 
 
 		 673 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.68 
 
 		 705 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  36.97 
 
 		 930 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  32.55 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  36.68 
 
 		 702 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.55 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  32.06 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.57 
 
 		 738 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.46 
 
 		 616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.4 
 
 		 653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  35.74 
 
 		 624 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  34.87 
 
 		 322 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.68 
 
 		 706 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.75 
 
 		 759 aa  133  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.23 
 
 		 633 aa  134  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  33.99 
 
 		 426 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.78 
 
 		 768 aa  134  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.24 
 
 		 687 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.16 
 
 		 601 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  33.21 
 
 		 335 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  30.69 
 
 		 613 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  37.33 
 
 		 322 aa  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.16 
 
 		 601 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.05 
 
 		 721 aa  133  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  37.21 
 
 		 829 aa  133  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.02 
 
 		 769 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.35 
 
 		 610 aa  133  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.29 
 
 		 731 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  33.99 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  32.4 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  33.07 
 
 		 613 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  37.44 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.12 
 
 		 731 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  33.47 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>