More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2457 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.8 
 
 		 610 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.33 
 
 		 624 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  55.22 
 
 		 615 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  54.92 
 
 		 630 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.59 
 
 		 610 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 615 aa  1236    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.89 
 
 		 645 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.65 
 
 		 623 aa  658    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  59.56 
 
 		 618 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  55.84 
 
 		 627 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.27 
 
 		 617 aa  695    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.87 
 
 		 635 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  57 
 
 		 621 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.67 
 
 		 616 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  56.01 
 
 		 605 aa  653    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  55.24 
 
 		 609 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57 
 
 		 618 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.84 
 
 		 605 aa  648    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57 
 
 		 618 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.64 
 
 		 618 aa  632  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.67 
 
 		 615 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 633 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  55.43 
 
 		 616 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.84 
 
 		 607 aa  620  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 		 696 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 		 714 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  55.79 
 
 		 617 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.36 
 
 		 647 aa  590  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  50.24 
 
 		 646 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 		 663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 		 663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 607 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.52 
 
 		 646 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.52 
 
 		 646 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  51.73 
 
 		 659 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 630 aa  547  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 		 676 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.39 
 
 		 655 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 		 655 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  50.08 
 
 		 635 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.72 
 
 		 615 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 		 658 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.14 
 
 		 614 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  48.07 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.78 
 
 		 608 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 		 687 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  49.83 
 
 		 627 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 		 637 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.09 
 
 		 625 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.32 
 
 		 673 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.8 
 
 		 645 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.32 
 
 		 673 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  46.91 
 
 		 681 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  50.35 
 
 		 645 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.3 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.65 
 
 		 645 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.34 
 
 		 645 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.33 
 
 		 641 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  47.14 
 
 		 623 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.68 
 
 		 643 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 		 658 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  47.12 
 
 		 621 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  46.33 
 
 		 641 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 		 658 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.15 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.73 
 
 		 623 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 		 612 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.68 
 
 		 648 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.67 
 
 		 681 aa  524  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  48.38 
 
 		 702 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.13 
 
 		 639 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.42 
 
 		 612 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  47.89 
 
 		 625 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.68 
 
 		 641 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  48.22 
 
 		 624 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  49.21 
 
 		 616 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.85 
 
 		 697 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  49.38 
 
 		 619 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.82 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  47.37 
 
 		 620 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 		 638 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 		 666 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47 
 
 		 676 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.84 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  46.84 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  46.84 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.06 
 
 		 662 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  46.68 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  46.84 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.84 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.62 
 
 		 653 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.96 
 
 		 649 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.1 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.99 
 
 		 717 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.1 
 
 		 852 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.99 
 
 		 713 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.1 
 
 		 666 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  46.84 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>