More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3109 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  100 
 
 		 366 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  52.65 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  49 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  49.22 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  43.67 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  50.44 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  47.62 
 
 		 322 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  49.56 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  49.56 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  47.27 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  47.27 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  44.79 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  34.71 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  41.5 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  36.91 
 
 		 328 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  36.82 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  44.57 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  35.89 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  45.11 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  38.89 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  38.89 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  44.63 
 
 		 322 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  33.74 
 
 		 327 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  42.78 
 
 		 391 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  35.15 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  34.36 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  34.36 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  34.8 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  38.12 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  38.29 
 
 		 335 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  34 
 
 		 308 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  34.13 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  36.22 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  50.38 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  35 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  34.01 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  34.24 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  35.78 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  32.49 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  40.85 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  34.8 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  35.19 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  36.76 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  35.45 
 
 		 370 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  38.19 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  34.32 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  39.53 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  34.44 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  37.63 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  35.29 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  33.18 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  32.4 
 
 		 468 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  33.61 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  36.07 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  39.74 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  41.72 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  40.24 
 
 		 477 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  39.08 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  37.98 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  31.95 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  39.64 
 
 		 493 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  39.77 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.57 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  41.67 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  36.06 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  37.8 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.48 
 
 		 759 aa  113  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  37.71 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  34.98 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  37.36 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  31.79 
 
 		 239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.12 
 
 		 735 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  37.79 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.97 
 
 		 737 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.97 
 
 		 737 aa  106  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.34 
 
 		 666 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.43 
 
 		 738 aa  106  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.67 
 
 		 769 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  39.26 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.9 
 
 		 736 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.31 
 
 		 768 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.47 
 
 		 718 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.12 
 
 		 852 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  29.29 
 
 		 408 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  31.12 
 
 		 412 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.46 
 
 		 731 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.05 
 
 		 731 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  38.52 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.05 
 
 		 731 aa  104  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.46 
 
 		 731 aa  104  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  33.8 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  35 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  38.52 
 
 		 371 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  30.24 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.46 
 
 		 760 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>