More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4641 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  911    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  41.15 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  45.27 
 
 		 459 aa  295  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  48.57 
 
 		 443 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2330  AAA ATPase central domain protein  37.58 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  44.37 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0031  cell division cycle protein 48-related protein  39.51 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0450  Microtubule-severing ATPase  41.55 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  41.9 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  37.58 
 
 		 607 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  41.25 
 
 		 599 aa  210  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.9 
 
 		 731 aa  209  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.98 
 
 		 731 aa  209  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.86 
 
 		 731 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.58 
 
 		 731 aa  206  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.56 
 
 		 800 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.56 
 
 		 781 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.63 
 
 		 735 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.51 
 
 		 727 aa  201  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.25 
 
 		 784 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.89 
 
 		 759 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  37.11 
 
 		 613 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.01 
 
 		 718 aa  197  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  37.88 
 
 		 713 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.3 
 
 		 719 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.69 
 
 		 736 aa  195  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.71 
 
 		 732 aa  195  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  44.34 
 
 		 722 aa  194  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.09 
 
 		 760 aa  194  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  40.95 
 
 		 804 aa  192  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  36.9 
 
 		 775 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.58 
 
 		 757 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.67 
 
 		 769 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.94 
 
 		 742 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.78 
 
 		 739 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.95 
 
 		 757 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.08 
 
 		 806 aa  190  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40 
 
 		 701 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.71 
 
 		 742 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.87 
 
 		 740 aa  189  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.11 
 
 		 754 aa  189  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  32.97 
 
 		 703 aa  189  9e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  42.99 
 
 		 800 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.87 
 
 		 743 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  42.55 
 
 		 673 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.69 
 
 		 737 aa  189  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.94 
 
 		 704 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.74 
 
 		 738 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  44 
 
 		 628 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.54 
 
 		 772 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  36.64 
 
 		 721 aa  186  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  36.8 
 
 		 749 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.55 
 
 		 641 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  39.22 
 
 		 806 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.66 
 
 		 740 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.96 
 
 		 757 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  44 
 
 		 784 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  43.69 
 
 		 739 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.35 
 
 		 852 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.64 
 
 		 738 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.59 
 
 		 715 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86417  mitochondrial protein of the CDC48/PAS1/SEC18 family of ATPases  41.49 
 
 		 703 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  40.6 
 
 		 829 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  34.94 
 
 		 754 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.85 
 
 		 721 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.25 
 
 		 756 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.25 
 
 		 737 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.99 
 
 		 738 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.96 
 
 		 755 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.57 
 
 		 709 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  39.61 
 
 		 691 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  42.13 
 
 		 640 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.97 
 
 		 768 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.09 
 
 		 753 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  44.2 
 
 		 703 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  34.65 
 
 		 866 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  38.96 
 
 		 685 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  43.5 
 
 		 746 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.98 
 
 		 754 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.42 
 
 		 808 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.81 
 
 		 638 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.5 
 
 		 640 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.75 
 
 		 805 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  38.26 
 
 		 810 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  38.66 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  35.64 
 
 		 810 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.5 
 
 		 642 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.92 
 
 		 781 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  45.91 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  42.67 
 
 		 612 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  40.77 
 
 		 814 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.5 
 
 		 642 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  33.93 
 
 		 763 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  43.81 
 
 		 640 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  43.36 
 
 		 638 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.36 
 
 		 638 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.05 
 
 		 645 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.5 
 
 		 642 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.23 
 
 		 736 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.36 
 
 		 638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>