More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1752 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
424 aa  847    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  49.47 
 
 
473 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0450  Microtubule-severing ATPase  48.37 
 
 
430 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  50.89 
 
 
464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  50.35 
 
 
443 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  44.44 
 
 
459 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  41.9 
 
 
446 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2330  AAA ATPase central domain protein  41.07 
 
 
458 aa  246  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0031  cell division cycle protein 48-related protein  40.04 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  41.28 
 
 
930 aa  206  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 
718 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  39.04 
 
 
599 aa  201  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  41.04 
 
 
607 aa  200  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  43.04 
 
 
804 aa  196  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  40.96 
 
 
866 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  40.32 
 
 
810 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.3 
 
 
784 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.3 
 
 
781 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.11 
 
 
800 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.83 
 
 
781 aa  189  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.25 
 
 
723 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  43.59 
 
 
814 aa  186  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  40.43 
 
 
806 aa  186  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.6 
 
 
754 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.37 
 
 
754 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.36 
 
 
731 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.57 
 
 
735 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.65 
 
 
727 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  41.05 
 
 
829 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.75 
 
 
731 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  39.58 
 
 
685 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.61 
 
 
760 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.64 
 
 
731 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.58 
 
 
759 aa  183  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.08 
 
 
754 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  45.02 
 
 
775 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.02 
 
 
731 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.52 
 
 
736 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.62 
 
 
719 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.86 
 
 
732 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.59 
 
 
738 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.12 
 
 
756 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.07 
 
 
757 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.08 
 
 
754 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.55 
 
 
738 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  39.42 
 
 
754 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.32 
 
 
736 aa  177  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.26 
 
 
808 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  41.38 
 
 
788 aa  176  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  42.13 
 
 
756 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  43.67 
 
 
763 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.56 
 
 
721 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.31 
 
 
737 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  41.1 
 
 
784 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41 
 
 
639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.61 
 
 
737 aa  173  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  38.04 
 
 
691 aa  173  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  40.24 
 
 
729 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  45.78 
 
 
764 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.17 
 
 
769 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.74 
 
 
768 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 
810 aa  171  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  42.98 
 
 
782 aa  169  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  40.07 
 
 
552 aa  170  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  43.69 
 
 
703 aa  169  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.86 
 
 
738 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.4 
 
 
730 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.34 
 
 
701 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.36 
 
 
615 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.57 
 
 
612 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.57 
 
 
612 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  36.33 
 
 
613 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.06 
 
 
630 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.15 
 
 
763 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.33 
 
 
635 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.39 
 
 
510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  39.57 
 
 
614 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  40.34 
 
 
722 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  37.92 
 
 
734 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  38.17 
 
 
645 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.91 
 
 
632 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.02 
 
 
697 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.02 
 
 
697 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.24 
 
 
640 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.53 
 
 
743 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.46 
 
 
638 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.24 
 
 
640 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.54 
 
 
653 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.39 
 
 
645 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.55 
 
 
625 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  42.41 
 
 
739 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  34.32 
 
 
703 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  39.46 
 
 
513 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  40 
 
 
628 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  35.59 
 
 
713 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  39.74 
 
 
700 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.26 
 
 
742 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  39.91 
 
 
442 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.34 
 
 
614 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.49 
 
 
739 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>