More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0450 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0450  Microtubule-severing ATPase  100 
 
 
430 aa  863    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  44.92 
 
 
473 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  47.54 
 
 
424 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  47.55 
 
 
464 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  53.02 
 
 
443 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  45.39 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2330  AAA ATPase central domain protein  43.57 
 
 
458 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  41.55 
 
 
446 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0031  cell division cycle protein 48-related protein  40.77 
 
 
448 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.523133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  41.86 
 
 
607 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  39.52 
 
 
599 aa  206  6e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  40.96 
 
 
866 aa  195  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.24 
 
 
731 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  39.08 
 
 
804 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.92 
 
 
731 aa  188  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.26 
 
 
731 aa  188  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.22 
 
 
731 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  40.68 
 
 
829 aa  183  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.85 
 
 
736 aa  182  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.23 
 
 
735 aa  182  8.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  38.98 
 
 
810 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.42 
 
 
732 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.86 
 
 
759 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.54 
 
 
737 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  39.08 
 
 
806 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.31 
 
 
718 aa  176  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.16 
 
 
738 aa  176  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.92 
 
 
737 aa  176  8e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.49 
 
 
760 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  37.85 
 
 
734 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  41.04 
 
 
749 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.54 
 
 
727 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  35.82 
 
 
754 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  37.6 
 
 
775 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.12 
 
 
736 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  39.83 
 
 
814 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  36.5 
 
 
832 aa  172  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  38.15 
 
 
733 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.34 
 
 
639 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.59 
 
 
719 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.46 
 
 
756 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.63 
 
 
754 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  40.27 
 
 
756 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  38.06 
 
 
741 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.29 
 
 
781 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.15 
 
 
739 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  38.06 
 
 
741 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  38.06 
 
 
741 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  36.03 
 
 
729 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.26 
 
 
754 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.68 
 
 
800 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.91 
 
 
784 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  36.96 
 
 
691 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.32 
 
 
808 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.19 
 
 
738 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  36.92 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.88 
 
 
768 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  37.27 
 
 
729 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  38.18 
 
 
747 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.88 
 
 
704 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  41.22 
 
 
748 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  35.54 
 
 
930 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.37 
 
 
630 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  37.64 
 
 
764 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  36.05 
 
 
703 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.67 
 
 
651 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.69 
 
 
715 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.39 
 
 
769 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  40.08 
 
 
613 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.9 
 
 
757 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  36.76 
 
 
763 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.03 
 
 
754 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.91 
 
 
723 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  41.67 
 
 
627 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.63 
 
 
653 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.22 
 
 
656 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  41.03 
 
 
803 aa  161  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  36.23 
 
 
713 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.19 
 
 
753 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.68 
 
 
781 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  37.74 
 
 
721 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  38.46 
 
 
722 aa  160  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.88 
 
 
755 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  36.73 
 
 
742 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  40.34 
 
 
737 aa  160  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.12 
 
 
757 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  36.58 
 
 
625 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.55 
 
 
701 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  37.74 
 
 
615 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  39.59 
 
 
728 aa  159  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.45 
 
 
721 aa  159  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  37.93 
 
 
651 aa  159  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.09 
 
 
740 aa  159  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  37.74 
 
 
617 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.13 
 
 
667 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.6 
 
 
673 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.21 
 
 
620 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.6 
 
 
673 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  37.74 
 
 
617 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  37.5 
 
 
615 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>