More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2076 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
473 aa  939    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  49.57 
 
 
424 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0450  Microtubule-severing ATPase  44.92 
 
 
430 aa  362  8e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  49.29 
 
 
464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  58.45 
 
 
443 aa  316  7e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  44.37 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2330  AAA ATPase central domain protein  43.16 
 
 
458 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0031  cell division cycle protein 48-related protein  40.26 
 
 
448 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  42.55 
 
 
459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  40.31 
 
 
607 aa  209  8e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.57 
 
 
759 aa  208  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  41.64 
 
 
804 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.37 
 
 
731 aa  207  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  40.32 
 
 
599 aa  206  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.21 
 
 
731 aa  206  8e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.01 
 
 
731 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.96 
 
 
718 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.63 
 
 
731 aa  204  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  39.85 
 
 
685 aa  204  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.84 
 
 
735 aa  202  8e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  43.6 
 
 
930 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  43.85 
 
 
806 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  44.39 
 
 
866 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.03 
 
 
760 aa  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.35 
 
 
743 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.12 
 
 
740 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.92 
 
 
732 aa  196  7e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.17 
 
 
754 aa  196  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.75 
 
 
736 aa  196  9e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.79 
 
 
769 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.35 
 
 
742 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.47 
 
 
784 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.68 
 
 
756 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.47 
 
 
781 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.75 
 
 
727 aa  193  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.47 
 
 
800 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  43.19 
 
 
814 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  44.4 
 
 
810 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  42.8 
 
 
703 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  42.37 
 
 
829 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  39.37 
 
 
775 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45 
 
 
742 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40 
 
 
738 aa  190  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.37 
 
 
739 aa  189  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.93 
 
 
768 aa  189  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  42.91 
 
 
729 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.27 
 
 
740 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.51 
 
 
730 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.73 
 
 
719 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.93 
 
 
723 aa  186  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  37.74 
 
 
722 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.44 
 
 
754 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.55 
 
 
721 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  41.33 
 
 
703 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.97 
 
 
639 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.06 
 
 
737 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  40.29 
 
 
810 aa  184  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.3 
 
 
737 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.78 
 
 
754 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.64 
 
 
757 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  43.23 
 
 
741 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.26 
 
 
805 aa  183  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  39.86 
 
 
754 aa  183  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.68 
 
 
738 aa  183  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  44.14 
 
 
756 aa  182  9.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.54 
 
 
781 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  40.61 
 
 
763 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  38.97 
 
 
764 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.26 
 
 
753 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.89 
 
 
757 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.29 
 
 
804 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  43.23 
 
 
741 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  43.23 
 
 
741 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.92 
 
 
615 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.75 
 
 
754 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.8 
 
 
757 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.76 
 
 
704 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  44.31 
 
 
747 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  41.45 
 
 
749 aa  180  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  39.48 
 
 
732 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.04 
 
 
736 aa  179  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  37.55 
 
 
713 aa  179  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.97 
 
 
808 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.85 
 
 
620 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.26 
 
 
805 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.92 
 
 
738 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  43.35 
 
 
733 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  39.45 
 
 
613 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  43.12 
 
 
748 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.68 
 
 
810 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  41.8 
 
 
691 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.53 
 
 
755 aa  176  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.06 
 
 
701 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  39.87 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.5 
 
 
640 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.9 
 
 
630 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  43.11 
 
 
832 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.21 
 
 
617 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.02 
 
 
660 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.75 
 
 
623 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>