More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01970 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  100 
 
 
782 aa  1607    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86417  mitochondrial protein of the CDC48/PAS1/SEC18 family of ATPases  55.74 
 
 
703 aa  595  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  53.99 
 
 
784 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37796  predicted protein  54.47 
 
 
636 aa  546  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  53 
 
 
514 aa  537  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.39 
 
 
643 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.19 
 
 
640 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.41 
 
 
644 aa  498  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  51.12 
 
 
639 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.25 
 
 
652 aa  495  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.64 
 
 
641 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.85 
 
 
641 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  50.31 
 
 
611 aa  482  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.71 
 
 
651 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.98 
 
 
642 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.7 
 
 
644 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.49 
 
 
640 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
651 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.16 
 
 
642 aa  482  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.51 
 
 
640 aa  482  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.16 
 
 
642 aa  482  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.8 
 
 
640 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  51.43 
 
 
613 aa  477  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 
640 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  48.34 
 
 
646 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  51.07 
 
 
641 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  47.55 
 
 
658 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.84 
 
 
645 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.29 
 
 
610 aa  477  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  48.34 
 
 
660 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  54.44 
 
 
800 aa  479  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.01 
 
 
626 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.93 
 
 
638 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  49.41 
 
 
644 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  47.7 
 
 
649 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.2 
 
 
612 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.59 
 
 
608 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 
651 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  49.61 
 
 
649 aa  475  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
643 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.41 
 
 
645 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.2 
 
 
657 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.2 
 
 
648 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.13 
 
 
640 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.61 
 
 
614 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  49.6 
 
 
659 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  53.2 
 
 
647 aa  472  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 
657 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.41 
 
 
656 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  49.8 
 
 
681 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.64 
 
 
643 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.08 
 
 
638 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.2 
 
 
647 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48 
 
 
676 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.41 
 
 
657 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.41 
 
 
657 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.5 
 
 
628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  48.38 
 
 
650 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  51.87 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  47.94 
 
 
649 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  52.97 
 
 
650 aa  468  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  47.06 
 
 
643 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.86 
 
 
657 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.42 
 
 
638 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.2 
 
 
612 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.64 
 
 
638 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.43 
 
 
651 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.2 
 
 
638 aa  469  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  46.11 
 
 
651 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.39 
 
 
657 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.39 
 
 
657 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.21 
 
 
652 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.39 
 
 
657 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  45.72 
 
 
660 aa  469  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.32 
 
 
657 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
621 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  47.74 
 
 
644 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
647 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  47.74 
 
 
644 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  47.74 
 
 
644 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.88 
 
 
637 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  52.47 
 
 
634 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.19 
 
 
655 aa  466  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  46.58 
 
 
647 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  47.74 
 
 
647 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.23 
 
 
650 aa  466  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  47.74 
 
 
647 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  47.62 
 
 
645 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.59 
 
 
654 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.62 
 
 
645 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  44.48 
 
 
644 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.42 
 
 
638 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  44.48 
 
 
647 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  46.58 
 
 
647 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  46.77 
 
 
647 aa  466  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  44.48 
 
 
647 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  47.74 
 
 
644 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  51.01 
 
 
612 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.8 
 
 
637 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.21 
 
 
652 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>