More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86417 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_86417  mitochondrial protein of the CDC48/PAS1/SEC18 family of ATPases  100 
 
 
703 aa  1450    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  50.49 
 
 
784 aa  627  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  55.74 
 
 
782 aa  595  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  60.05 
 
 
514 aa  508  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37796  predicted protein  53.6 
 
 
636 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.54 
 
 
640 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.94 
 
 
652 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.7 
 
 
643 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.25 
 
 
643 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.5 
 
 
648 aa  475  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.7 
 
 
645 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 
626 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
641 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  49.9 
 
 
681 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.42 
 
 
644 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
638 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.97 
 
 
647 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.88 
 
 
641 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  54.04 
 
 
800 aa  467  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.84 
 
 
645 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  48 
 
 
611 aa  465  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  47.07 
 
 
640 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.48 
 
 
638 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.9 
 
 
610 aa  465  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.97 
 
 
638 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.88 
 
 
630 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.48 
 
 
638 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.29 
 
 
638 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.48 
 
 
638 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.32 
 
 
628 aa  462  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 
642 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 
642 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  47.74 
 
 
649 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.53 
 
 
640 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.5 
 
 
640 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 
642 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.11 
 
 
651 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
651 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.78 
 
 
643 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.1 
 
 
637 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  45.33 
 
 
651 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 
640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  47.54 
 
 
644 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.98 
 
 
634 aa  456  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.19 
 
 
651 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.89 
 
 
640 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.44 
 
 
640 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.32 
 
 
640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  49.89 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  46.92 
 
 
639 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  47.31 
 
 
764 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  45.44 
 
 
638 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.52 
 
 
638 aa  452  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  45.42 
 
 
639 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  48.89 
 
 
634 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  49.23 
 
 
642 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.18 
 
 
657 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  48.89 
 
 
634 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.18 
 
 
657 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.42 
 
 
639 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  49 
 
 
635 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  45.73 
 
 
641 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.22 
 
 
640 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.73 
 
 
642 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.63 
 
 
636 aa  450  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  47.59 
 
 
641 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.22 
 
 
634 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.18 
 
 
657 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.22 
 
 
644 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.45 
 
 
655 aa  452  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.56 
 
 
647 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.6 
 
 
650 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  49.23 
 
 
639 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49 
 
 
637 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.75 
 
 
659 aa  449  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  46.52 
 
 
649 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.78 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 
655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  46.09 
 
 
626 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.71 
 
 
673 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.42 
 
 
638 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 
630 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  44.19 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.68 
 
 
652 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.18 
 
 
652 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.13 
 
 
640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.88 
 
 
657 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.29 
 
 
633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.22 
 
 
637 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.33 
 
 
655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.45 
 
 
640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.67 
 
 
660 aa  449  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  49.11 
 
 
647 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 
631 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  49 
 
 
658 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.66 
 
 
657 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.07 
 
 
631 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
631 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>