More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5327 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
327 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  73.93 
 
 
329 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  73.93 
 
 
329 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  53.68 
 
 
328 aa  360  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  53.87 
 
 
328 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  52.78 
 
 
322 aa  350  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  54.04 
 
 
328 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  51.06 
 
 
328 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  54.25 
 
 
336 aa  332  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  54.61 
 
 
328 aa  332  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  51.86 
 
 
332 aa  329  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  47.38 
 
 
326 aa  322  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  47.43 
 
 
335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  46.99 
 
 
335 aa  318  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  47.83 
 
 
327 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  47.83 
 
 
327 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  51.06 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  48 
 
 
321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  43.94 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  48.48 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  47.06 
 
 
330 aa  291  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  43.03 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  45.82 
 
 
336 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  45.82 
 
 
336 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  44.58 
 
 
336 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  36.62 
 
 
333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.38 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 
335 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  35.35 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.32 
 
 
332 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  35.89 
 
 
366 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  33.67 
 
 
324 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  39.27 
 
 
322 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  36.14 
 
 
308 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  39.47 
 
 
387 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  33.66 
 
 
322 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.63 
 
 
338 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  35.02 
 
 
335 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  39.9 
 
 
369 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  40.33 
 
 
325 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  32.79 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  27.44 
 
 
391 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  36.97 
 
 
360 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  34.95 
 
 
388 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  36.53 
 
 
323 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  35.02 
 
 
390 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  36.53 
 
 
323 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  37.89 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  34.88 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  31.95 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  31.54 
 
 
332 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  31.54 
 
 
332 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  24.57 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  33.64 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  41.92 
 
 
345 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  34.53 
 
 
405 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  36.59 
 
 
370 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  35.35 
 
 
367 aa  122  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  34.19 
 
 
459 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.12 
 
 
477 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  34.57 
 
 
419 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 
239 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  29.41 
 
 
425 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.48 
 
 
451 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  28.79 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.63 
 
 
493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.88 
 
 
401 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  28.34 
 
 
424 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  26.63 
 
 
468 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  28.7 
 
 
428 aa  105  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  28.24 
 
 
419 aa  105  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  33.67 
 
 
804 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.6 
 
 
655 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.74 
 
 
640 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  33.77 
 
 
617 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44098  predicted protein  31.69 
 
 
494 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0738436 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  38.26 
 
 
371 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  34.12 
 
 
426 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  31.17 
 
 
641 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.19 
 
 
642 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  30.85 
 
 
372 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.76 
 
 
638 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.17 
 
 
639 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.48 
 
 
627 aa  100  4e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  31.17 
 
 
639 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  28.47 
 
 
639 aa  99.8  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  36.91 
 
 
371 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  30.83 
 
 
622 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  33.33 
 
 
617 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  33.33 
 
 
617 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  30.88 
 
 
607 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  32.02 
 
 
602 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.14 
 
 
676 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  37.06 
 
 
692 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  29.27 
 
 
640 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  30.97 
 
 
615 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  28.47 
 
 
642 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  30.95 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.34 
 
 
651 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  30.97 
 
 
615 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>