More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0513 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  100 
 
 
401 aa  812    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  34.17 
 
 
388 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  34.36 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  32.04 
 
 
367 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  36.4 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  36.71 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  33.15 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  31.1 
 
 
389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.63 
 
 
370 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  35.48 
 
 
405 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  35.92 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.73 
 
 
348 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  41.03 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  45.51 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  32.94 
 
 
360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  32.58 
 
 
324 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  32.82 
 
 
387 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  33.61 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 
390 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  36.75 
 
 
345 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  39.42 
 
 
493 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  40.7 
 
 
459 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  39.53 
 
 
366 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  38.79 
 
 
477 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  44.87 
 
 
320 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  44.81 
 
 
323 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  44.81 
 
 
323 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  39.62 
 
 
338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.61 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  35.05 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  41.62 
 
 
332 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  41.62 
 
 
332 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  34.57 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  40.29 
 
 
451 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  37.87 
 
 
425 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  29.92 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  29.92 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  42 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  35.04 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  38.42 
 
 
328 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  37.98 
 
 
428 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  35.56 
 
 
430 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  37.19 
 
 
468 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  28.42 
 
 
327 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  34.78 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  39.27 
 
 
419 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  32.2 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  32.17 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  31.67 
 
 
328 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  31.34 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  36.45 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  35.1 
 
 
326 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  38.28 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  31.69 
 
 
328 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  40.68 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 
328 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  40 
 
 
427 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  34.47 
 
 
308 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  34.93 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 
330 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  33.97 
 
 
336 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  33.48 
 
 
336 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  35.88 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  38.5 
 
 
407 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 
336 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  36.16 
 
 
325 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  33.16 
 
 
328 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  38.67 
 
 
336 aa  107  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  25.17 
 
 
335 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  36.87 
 
 
372 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  25.83 
 
 
335 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  31.87 
 
 
327 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  31.87 
 
 
327 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  25.95 
 
 
321 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  37.02 
 
 
371 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 
239 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  35 
 
 
406 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  34.58 
 
 
410 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  42.54 
 
 
371 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  43.28 
 
 
371 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  35.56 
 
 
404 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  35.41 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.67 
 
 
740 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  36.06 
 
 
930 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.13 
 
 
701 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  41.04 
 
 
371 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  29.43 
 
 
367 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  34 
 
 
405 aa  96.3  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.04 
 
 
769 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  33.33 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.67 
 
 
638 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  34.65 
 
 
631 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.63 
 
 
760 aa  95.1  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.23 
 
 
772 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  31.25 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  41.04 
 
 
371 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  34.29 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  36.67 
 
 
652 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  32.9 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>