More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2857 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  61.92 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  58.9 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  58.9 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  58.39 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  58.88 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  53.66 
 
 		 328 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  54.52 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  51.53 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  56.67 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  54.83 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  53.21 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  51.85 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  54.61 
 
 		 327 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  51.54 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  52.29 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  48.77 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  49.84 
 
 		 326 aa  318  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  50.83 
 
 		 325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  48.14 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  46.71 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  48.05 
 
 		 336 aa  299  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  45.05 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  46.55 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  46.25 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  40.58 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.71 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  33.96 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.63 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  36.62 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  34.36 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  31.74 
 
 		 324 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  36.51 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  33.12 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  34.44 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  36.82 
 
 		 366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  33.84 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  33.84 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  35.89 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  36.69 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  27.54 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  35.51 
 
 		 360 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  33.97 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  33.97 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  37.31 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  37.26 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  36.04 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  37.74 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  36.55 
 
 		 390 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  34.8 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  41.4 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  36.04 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.73 
 
 		 370 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 		 239 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  39.05 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  38.21 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.47 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 		 468 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  34.8 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  31.97 
 
 		 419 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  32.17 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  32.97 
 
 		 419 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  30.8 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  33.2 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  32.27 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  30.08 
 
 		 424 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  34.39 
 
 		 641 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.28 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.62 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.05 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  31.51 
 
 		 426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.12 
 
 		 659 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  36.07 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  32.33 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  34.87 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 644 aa  109  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  33.49 
 
 		 804 aa  109  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 		 643 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  32.08 
 
 		 648 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.9 
 
 		 759 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  35.62 
 
 		 613 aa  107  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.98 
 
 		 768 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  29.39 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.78 
 
 		 638 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.01 
 
 		 685 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  33.95 
 
 		 810 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  31.7 
 
 		 641 aa  106  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  32.78 
 
 		 640 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.78 
 
 		 638 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.78 
 
 		 638 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  35.12 
 
 		 499 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.7 
 
 		 687 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.08 
 
 		 644 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.51 
 
 		 769 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.12 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  32.78 
 
 		 638 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  33.62 
 
 		 803 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.2 
 
 		 638 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  35.78 
 
 		 691 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>