More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2677 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  63.3 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  58.57 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  58.39 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  56.83 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  54.63 
 
 		 328 aa  362  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  53.87 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  53.7 
 
 		 329 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  53.4 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  53.92 
 
 		 326 aa  342  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  50.77 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  50.77 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  53.87 
 
 		 332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  54.6 
 
 		 336 aa  338  5e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  54.57 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  53.09 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  52.29 
 
 		 335 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  51.68 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  51.09 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  52 
 
 		 336 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  50.93 
 
 		 336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  47.99 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  44.51 
 
 		 327 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  48.16 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  47.53 
 
 		 321 aa  298  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  41.95 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  36.36 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.99 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  33.54 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.71 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  33.23 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  32.18 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.71 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  33.53 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.14 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  36.67 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  33.44 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  38.04 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  33.97 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.09 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  33.97 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  32.26 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  32.89 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  32.89 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  37.1 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  28.79 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  40.22 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  38.51 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  35.78 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  35.86 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  38.92 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  37.71 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.42 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  29.93 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  38.86 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  35.2 
 
 		 419 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 		 239 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  40 
 
 		 405 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  38.42 
 
 		 401 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.66 
 
 		 425 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  37.96 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  33.17 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  36.69 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  29.46 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  28.69 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  30.86 
 
 		 477 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  30.71 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  30.2 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  31.28 
 
 		 427 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  30.59 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  28.63 
 
 		 493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  27.31 
 
 		 424 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  31.38 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  38.5 
 
 		 641 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  36.16 
 
 		 803 aa  105  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  33.74 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  31.88 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  27.35 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  33.07 
 
 		 1284 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  34.65 
 
 		 680 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.64 
 
 		 644 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  31.98 
 
 		 584 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.3 
 
 		 659 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.6 
 
 		 584 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  31.55 
 
 		 607 aa  99.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  27.84 
 
 		 394 aa  99.8  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  30.2 
 
 		 407 aa  99.8  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  35.93 
 
 		 243 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  31.56 
 
 		 663 aa  99.4  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.48 
 
 		 640 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  36.67 
 
 		 866 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  31.8 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  33.51 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  31.42 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  33.87 
 
 		 1301 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  31.42 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  32.29 
 
 		 424 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  32.97 
 
 		 639 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.96 
 
 		 718 aa  96.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  32.22 
 
 		 656 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>