More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5489 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 336 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  89.88 
 
 		 336 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  87.8 
 
 		 336 aa  590  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  76.51 
 
 		 336 aa  524  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  76.36 
 
 		 330 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  52.63 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  49.85 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  52 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  51.85 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  46.15 
 
 		 328 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  47.65 
 
 		 328 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  46.25 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  46.11 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  45.82 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  45.76 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  45.03 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  45.02 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  44.71 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  41.87 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  41.87 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  45.63 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  40.49 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  44.98 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  41.19 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  42.81 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  38.26 
 
 		 326 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.02 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  32.7 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  31.86 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  34.3 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  36.12 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  36.24 
 
 		 369 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.32 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  40.21 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  26.61 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  33.6 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  37.93 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  36.95 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  29.49 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  36.82 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  37.44 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  37.93 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.6 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  31.17 
 
 		 367 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  32.95 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  30.16 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  29.84 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  38.21 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  40.78 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  36.51 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  32.79 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  32.79 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  30.84 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  31.23 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  31.05 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  34.76 
 
 		 239 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.71 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  38.15 
 
 		 355 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  39.18 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  34.85 
 
 		 419 aa  112  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.67 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  30.52 
 
 		 477 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  33.97 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  33.77 
 
 		 419 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.51 
 
 		 459 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.48 
 
 		 468 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  33.52 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.28 
 
 		 493 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  37.14 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  30.33 
 
 		 427 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  30.89 
 
 		 451 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  33.62 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  31.28 
 
 		 424 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  33.19 
 
 		 688 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  33.51 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  35.14 
 
 		 624 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  35.74 
 
 		 620 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  34.17 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  35.59 
 
 		 620 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.16 
 
 		 615 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  35.14 
 
 		 620 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  31.2 
 
 		 425 aa  99.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  35.05 
 
 		 650 aa  99.4  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  33.33 
 
 		 638 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  33.05 
 
 		 1284 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  34.68 
 
 		 620 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 		 655 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 		 662 aa  99  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  34.23 
 
 		 635 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  34.54 
 
 		 660 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  34.54 
 
 		 658 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.05 
 
 		 657 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  35.05 
 
 		 659 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  34.68 
 
 		 625 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  31.98 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  33.85 
 
 		 651 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.05 
 
 		 655 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  39.33 
 
 		 754 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>