More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1798 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  54.2 
 
 
1301 aa  1418    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  100 
 
 
1284 aa  2650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.89 
 
 
611 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  37.84 
 
 
602 aa  280  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  37.44 
 
 
646 aa  279  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.02 
 
 
676 aa  278  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  37.14 
 
 
619 aa  275  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  35.56 
 
 
614 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.67 
 
 
643 aa  274  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.63 
 
 
621 aa  274  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.74 
 
 
619 aa  273  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  35.63 
 
 
608 aa  271  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  35.76 
 
 
617 aa  271  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.26 
 
 
660 aa  271  8e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.94 
 
 
620 aa  270  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.63 
 
 
660 aa  270  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  35.54 
 
 
617 aa  270  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.6 
 
 
612 aa  270  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  35.54 
 
 
617 aa  270  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.71 
 
 
639 aa  268  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  35.14 
 
 
633 aa  268  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  35.14 
 
 
633 aa  268  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  35.14 
 
 
633 aa  268  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  35.14 
 
 
633 aa  268  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  35.14 
 
 
633 aa  268  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.35 
 
 
616 aa  268  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  35.14 
 
 
633 aa  268  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  34.89 
 
 
617 aa  267  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.43 
 
 
632 aa  267  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.2 
 
 
635 aa  267  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.38 
 
 
612 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.38 
 
 
640 aa  266  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.93 
 
 
601 aa  266  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.68 
 
 
651 aa  265  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.93 
 
 
601 aa  266  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  34.71 
 
 
633 aa  265  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37796  predicted protein  36.38 
 
 
636 aa  265  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.71 
 
 
577 aa  264  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  34.97 
 
 
665 aa  264  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.53 
 
 
656 aa  264  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.24 
 
 
633 aa  264  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.96 
 
 
625 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.78 
 
 
617 aa  263  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.49 
 
 
633 aa  263  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  34.49 
 
 
633 aa  264  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  34.53 
 
 
613 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.96 
 
 
639 aa  263  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.68 
 
 
615 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  31.08 
 
 
652 aa  263  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  35.84 
 
 
800 aa  263  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  34.71 
 
 
633 aa  262  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.01 
 
 
640 aa  262  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.83 
 
 
647 aa  262  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.52 
 
 
634 aa  262  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.12 
 
 
652 aa  262  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.38 
 
 
628 aa  262  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  35.1 
 
 
619 aa  261  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.68 
 
 
637 aa  261  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.22 
 
 
671 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  33.94 
 
 
623 aa  261  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  35.04 
 
 
625 aa  261  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  35.2 
 
 
616 aa  261  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.57 
 
 
623 aa  261  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  36.24 
 
 
617 aa  261  7e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 
616 aa  260  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.23 
 
 
602 aa  261  9e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.69 
 
 
655 aa  261  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 
616 aa  260  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  34.7 
 
 
647 aa  260  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  35.57 
 
 
630 aa  260  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.71 
 
 
639 aa  260  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.02 
 
 
599 aa  260  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  36.22 
 
 
708 aa  260  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  36.49 
 
 
616 aa  259  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.57 
 
 
644 aa  259  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.63 
 
 
610 aa  259  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.16 
 
 
610 aa  259  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.03 
 
 
630 aa  259  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.93 
 
 
642 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  35.06 
 
 
628 aa  259  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  34.7 
 
 
650 aa  259  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  36.91 
 
 
651 aa  259  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  36.65 
 
 
782 aa  259  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.14 
 
 
697 aa  259  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  34.86 
 
 
611 aa  259  3e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.14 
 
 
697 aa  259  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  34.9 
 
 
613 aa  259  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.28 
 
 
656 aa  258  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  35.06 
 
 
700 aa  258  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.92 
 
 
612 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 
608 aa  258  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.29 
 
 
640 aa  258  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.92 
 
 
673 aa  258  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.03 
 
 
655 aa  258  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.43 
 
 
647 aa  258  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.92 
 
 
673 aa  258  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  35.32 
 
 
639 aa  258  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  34.45 
 
 
639 aa  258  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.59 
 
 
759 aa  257  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.41 
 
 
610 aa  257  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>