More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4255 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 688 aa  1410    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5461  AAA ATPase, central region  38.48 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0120801 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  39 
 
 		 646 aa  278  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5232  AAA ATPase, central region  35.86 
 
 		 688 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000286955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1548  AAA ATPase, central region  32.97 
 
 		 688 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000910509  normal  0.627937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  30.27 
 
 		 585 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  29.96 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 805 aa  173  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.72 
 
 		 718 aa  172  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.94 
 
 		 740 aa  170  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.61 
 
 		 760 aa  169  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.92 
 
 		 742 aa  169  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.18 
 
 		 740 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.49 
 
 		 804 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  28.4 
 
 		 729 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  29.51 
 
 		 599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 826 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  29.96 
 
 		 703 aa  165  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.81 
 
 		 738 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.62 
 
 		 739 aa  164  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.68 
 
 		 769 aa  163  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  28.17 
 
 		 607 aa  163  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.57 
 
 		 768 aa  163  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  31.96 
 
 		 754 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  29.83 
 
 		 713 aa  161  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.45 
 
 		 738 aa  160  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  31.55 
 
 		 814 aa  160  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  29.62 
 
 		 829 aa  160  8e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.2 
 
 		 743 aa  160  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  30.07 
 
 		 810 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.34 
 
 		 806 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.37 
 
 		 723 aa  159  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.57 
 
 		 742 aa  158  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.26 
 
 		 732 aa  158  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.78 
 
 		 736 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.52 
 
 		 737 aa  157  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.69 
 
 		 804 aa  157  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  31.63 
 
 		 703 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.41 
 
 		 810 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.84 
 
 		 808 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  26.98 
 
 		 722 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  29.96 
 
 		 739 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  31.55 
 
 		 763 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  32.28 
 
 		 764 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.99 
 
 		 801 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  31.05 
 
 		 746 aa  154  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  28.88 
 
 		 788 aa  153  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.25 
 
 		 805 aa  153  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.44 
 
 		 759 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.5 
 
 		 852 aa  152  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.57 
 
 		 737 aa  152  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.19 
 
 		 727 aa  150  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.65 
 
 		 754 aa  150  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.7 
 
 		 736 aa  150  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.61 
 
 		 757 aa  150  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  28.79 
 
 		 806 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.89 
 
 		 735 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  29.91 
 
 		 699 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  29.83 
 
 		 803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.32 
 
 		 773 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 810 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.3 
 
 		 754 aa  148  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.93 
 
 		 731 aa  148  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.82 
 
 		 731 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.19 
 
 		 754 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.43 
 
 		 756 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.33 
 
 		 719 aa  147  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  27.56 
 
 		 775 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.06 
 
 		 772 aa  147  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.48 
 
 		 731 aa  146  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.3 
 
 		 754 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.36 
 
 		 701 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.04 
 
 		 731 aa  145  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  29.78 
 
 		 647 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.19 
 
 		 721 aa  144  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  30.51 
 
 		 732 aa  143  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.26 
 
 		 801 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.23 
 
 		 730 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.18 
 
 		 704 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.54 
 
 		 763 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  29.15 
 
 		 613 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  39.15 
 
 		 317 aa  140  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  28.22 
 
 		 718 aa  137  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.62 
 
 		 755 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.95 
 
 		 753 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.41 
 
 		 757 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  39.38 
 
 		 866 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.26 
 
 		 715 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  28.67 
 
 		 781 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.22 
 
 		 709 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  28.22 
 
 		 601 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  27.17 
 
 		 930 aa  133  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  26.71 
 
 		 721 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  28.19 
 
 		 685 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  30.05 
 
 		 776 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  27.82 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.58 
 
 		 757 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  28.37 
 
 		 567 aa  130  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.33 
 
 		 784 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.89 
 
 		 676 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>