More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5461 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5461  AAA ATPase, central region  100 
 
 
577 aa  1185    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0120801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1548  AAA ATPase, central region  43.01 
 
 
688 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000910509  normal  0.627937 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5232  AAA ATPase, central region  42.47 
 
 
688 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000286955  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  40.72 
 
 
646 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  38.48 
 
 
688 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  32.12 
 
 
746 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.33 
 
 
740 aa  179  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.54 
 
 
742 aa  177  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.67 
 
 
737 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.12 
 
 
740 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.47 
 
 
739 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.88 
 
 
804 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.05 
 
 
738 aa  172  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.32 
 
 
736 aa  171  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.11 
 
 
739 aa  170  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.69 
 
 
743 aa  170  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.31 
 
 
759 aa  170  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  31.62 
 
 
699 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  31.5 
 
 
703 aa  167  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.69 
 
 
742 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.23 
 
 
769 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.7 
 
 
737 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.32 
 
 
718 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  27.52 
 
 
866 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.73 
 
 
852 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.47 
 
 
731 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.91 
 
 
730 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.95 
 
 
768 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.43 
 
 
760 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.07 
 
 
810 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.09 
 
 
808 aa  159  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28 
 
 
721 aa  159  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  30.74 
 
 
814 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.21 
 
 
754 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  29 
 
 
775 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.21 
 
 
805 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.18 
 
 
738 aa  159  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  29.17 
 
 
754 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.41 
 
 
804 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.21 
 
 
732 aa  158  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.89 
 
 
731 aa  158  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.02 
 
 
738 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.85 
 
 
805 aa  157  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.81 
 
 
754 aa  157  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  29.72 
 
 
703 aa  156  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  30.5 
 
 
713 aa  156  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.89 
 
 
731 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  28.99 
 
 
829 aa  156  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  29.78 
 
 
788 aa  154  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.39 
 
 
731 aa  154  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  29.44 
 
 
550 aa  154  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.03 
 
 
754 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.71 
 
 
735 aa  153  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 
810 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.92 
 
 
723 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  29.92 
 
 
810 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.53 
 
 
757 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.47 
 
 
727 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.68 
 
 
806 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.19 
 
 
756 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.2 
 
 
772 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  28.16 
 
 
639 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.8 
 
 
719 aa  151  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  26.58 
 
 
599 aa  150  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  28.66 
 
 
585 aa  150  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.62 
 
 
801 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.33 
 
 
801 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  28.96 
 
 
763 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  26.34 
 
 
722 aa  147  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  30.26 
 
 
776 aa  147  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  28.3 
 
 
803 aa  146  8.000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  31.6 
 
 
764 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  28.86 
 
 
718 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.25 
 
 
709 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  25.89 
 
 
607 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  28 
 
 
806 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.95 
 
 
753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.54 
 
 
763 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.51 
 
 
715 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  27.96 
 
 
613 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  26.72 
 
 
721 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  29.81 
 
 
732 aa  138  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  29.08 
 
 
601 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  28.81 
 
 
685 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.67 
 
 
701 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.68 
 
 
755 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  29.73 
 
 
729 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.79 
 
 
704 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.17 
 
 
757 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.9 
 
 
773 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  28.75 
 
 
930 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.94 
 
 
757 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  27.95 
 
 
647 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  25.3 
 
 
781 aa  116  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  40.44 
 
 
464 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.8 
 
 
793 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  27.01 
 
 
567 aa  110  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.16 
 
 
754 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.16 
 
 
801 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.25 
 
 
794 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>