More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2640 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  44.44 
 
 
335 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  35.87 
 
 
328 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  36.36 
 
 
335 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  35.56 
 
 
325 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.43 
 
 
326 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  35.78 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  32.72 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  36.17 
 
 
328 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  34.26 
 
 
328 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  32.72 
 
 
329 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  34.17 
 
 
322 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  33.54 
 
 
328 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  34.05 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  34.36 
 
 
328 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  33.54 
 
 
328 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  32.32 
 
 
327 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  32.31 
 
 
326 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  32.59 
 
 
332 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.37 
 
 
308 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 
327 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 
327 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  32.02 
 
 
336 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  30.82 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.4 
 
 
348 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.86 
 
 
363 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  31.97 
 
 
338 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  32.53 
 
 
336 aa  149  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  32.64 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  31.92 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  31 
 
 
336 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  30.9 
 
 
336 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  29.63 
 
 
336 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  32.09 
 
 
330 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  32.04 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  29.32 
 
 
352 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  34.02 
 
 
345 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  33.19 
 
 
366 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  35.16 
 
 
322 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  32.74 
 
 
324 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  30.99 
 
 
332 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  30.99 
 
 
332 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  31.42 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  31.42 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  34.2 
 
 
390 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  32.23 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  35.18 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  35.57 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.04 
 
 
401 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.75 
 
 
370 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  31.67 
 
 
405 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  27.96 
 
 
391 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.51 
 
 
477 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  32.02 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  32.6 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.38 
 
 
468 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  38.27 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.8 
 
 
493 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  32.65 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  32.11 
 
 
613 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.06 
 
 
459 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  36.69 
 
 
239 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.11 
 
 
613 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.57 
 
 
616 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  32.11 
 
 
613 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.57 
 
 
616 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.11 
 
 
612 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  30.49 
 
 
367 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.94 
 
 
759 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.86 
 
 
769 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.65 
 
 
616 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.37 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  31.19 
 
 
613 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  33.67 
 
 
466 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.03 
 
 
736 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  30.09 
 
 
866 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 
355 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
737 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.03 
 
 
738 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  31.47 
 
 
599 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  29.36 
 
 
617 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  29.36 
 
 
616 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  30.41 
 
 
692 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  33.01 
 
 
393 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.84 
 
 
737 aa  106  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.44 
 
 
754 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.28 
 
 
644 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.81 
 
 
768 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.38 
 
 
798 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  28.9 
 
 
615 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  28.9 
 
 
615 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.02 
 
 
804 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  33.92 
 
 
388 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.7 
 
 
660 aa  104  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.41 
 
 
630 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  29.36 
 
 
602 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  33.33 
 
 
421 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  30.28 
 
 
628 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  28.9 
 
 
615 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>